RESUMEN E l objetivo principal de esta tesis ha sido evaluar el rendimiento reproductivo de cuatro líneas maternales de conejos, de sus correspondientes cruces y la estima de los parámetros genéticos del cruzamiento, a partir de un cruce dialélico completo. Las líneas involucradas fueron la A, V, H y LP, fundadas bajo diferentes criterios pero, todas ellas, seleccionadas desde su origen hasta la actualidad por tamaño de camada al destete. Estas líneas se encuentran actualmente en la generación 41, 37, 20 y 7, respectivamente. En el tercer capítulo, la comparación entre las líneas se hizo en la fundación de las mismas, usando un modelo animal mixto que incluía los efectos aleatorios aditivos y permanentes. Para realizar este análisis se consideró el proceso de selección, ya que se incluyó el conjunto completo de datos (recogidos desde junio de 1980 hasta febrero de 2009) y el pedigrí integro. La segunda comparación se realizó en un tiempo fijo, los últimos dieciocho meses en los las hembras de tres líneas diferentes compartieron la misma granja y estuvieron bajo las mismas condiciones de manejo y alimentación. Estos periodos correspondieron a los intervalos que van: i) Desde marzo de 1997 hasta agosto de 1998 para las líneas A, V y H, y ii) Desde septiembre de 2007 hasta febrero de 2009 para las líneas A, V y LP. Los modelos utilizados para estos análisis no incluyeron el efecto genético aditivo y solo se consideraron los datos provenientes de dichos periodos, por consiguiente, las comparaciones entre las líneas no dependieron del modelo genético. Las medias por camada, de los 47,132 partos producidos por las 12,639 conejas involucradas en este estudio, fueron de 9.8, 9.07, 7.79 y 6.95 para número total de gazapos nacidos, número de nacidos vivos, número de destetados y número de sacrificados, respectivamente, y un intervalo entre partos de 49.80 días. Se puede observar como estas líneas tienen altos niveles productivos. En los respectivos momentos de fundación, la línea A mostró el menor tamaño de camada, siendo importante las diferencias con las medias combinadas de las otras líneas: 1.39 gazapos/camada para el total de nacidos, 1.2 para el número de nacidos vivos, 0.84 para el número de destetados y 1.06 para el número de sacrificados. Las líneas V y H no mostraron diferencias significativas para los caracteres de tamaño de camada, pero para el intervalo entre partos, el contraste fue 3.30±0.72días, que resultó significativo a favor de la línea H. La línea LP superó a la V en aproximadamente un gazapo para todos los caracteres de tamaño de camada estudiados. Las diferencias entre estas líneas para el intervalo entre partos fueron despreciables. Algunas interacciones, como la interacción entre línea y granja-año-estación resultaron importantes. Con respecto a la comparación entre las líneas A, V y H en el periodo que va desde marzo de 1997 hasta agosto de 1998, el patrón de las diferencias entre la línea A y las demás fue similar al observado en la fundación, y sólo se encontraron diferencias significativas entre las líneas V y H para el intervalo entre partos (4.62 días a favor de la línea V). La comparación entre las líneas A, V y LP, desde septiembre de 2007 hasta febrero de 2009 mostró una aproximación en sus rendimientos reproductivos, si son comparados con las diferencias que existían en el origen. De forma general, en la comparación de las líneas para los caracteres de tamaño de camada se observó una gran similitud en los periodos de tiempo fijo, usando un modelo sin efectos genético y datos recogidos durante los periodos de comparación, y las predicciones derivadas de los modelos con efectos genéticos. Otro punto a tener en cuenta, es la importancia del criterio utilizado para seleccionar los animales fundadores de cada línea, ya que determinarán los niveles iniciales de estos rendimientos reproductivos. El objetivo principal del capítulo 4 fue usar los datos genealógicos y de tamaño de camada de las líneas anteriormente mencionadas para: i) estimar sus tamaños de población efectiva, como una medida del incremento de la tasa consanguinidad y ii) estudiar si el efecto de la consanguinidad en los caracteres de tamaño de camada dependen del patrón de acumulación en el tiempo. Las líneas se han mantenido cerradas, en el mismo núcleo de selección, siguiendo el mismo manejo y programa de selección. Algunas prácticas, en lo correspondiente al apareamiento yla selección de los animales, como pueda ser evitar apareamientos entre animales con abuelos comunes y hacer que cada macho contribuya con un hijo a la siguiente generación, han permitido un incremento del coeficiente de consanguinidad menor de 0.01 por generación en estas líneas, cuyo tamaño, por generación, es alrededor de 25 machos y 125 hembras cada una. El tamaño efectivo de la población (Ne) para estas líneas estuvo entorno a 57.3, mostrando que el efecto de la selección, que produce un incremento de la consanguinidad, ha sido en parte contrarrestado por el manejo empleado. La consanguinidad de cada individuo fue dividida en tres componentes: consanguinidad vieja (consanguinidad acumulada entre la fundación de la línea y la generación 15ª para los animales nacidos después de la generación 30ª), intermedia (consanguinidad acumulada entre las generaciones 15ª a la 30ª para animales nacidos después de la generación 30ª o la consanguinidad acumulada en las primeras 15 generaciones para los animales nacidos antes de la generación 30ª) y nueva (las demás situaciones). Los coeficientes de regresión de la consanguinidad vieja, intermedia y nueva, por camada, en el número total de nacidos (TB), número de nacidos vivos (NBA) y número de destetados (NW), mostraron una tendencia decreciente desde valores positivos hasta valores negativos. Los coeficientes de regresión significativamente diferentes de cero fueron los de la consanguinidad vieja en TB (6.79±2.37) y NBA (5.92±2.37). El contraste de los coeficientes de regresión entre la consanguinidad vieja y la nueva fue significativo para los tres caracteres de tamaño de camada: 7.57±1.72 para TB; 6.66±1.73 paraNBA y 5.13±1.67 para NW. Estos resultados se han interpretado como la acción combinada de la purga de genes desfavorables y de la selección artificial, favorecida por la consanguinidad a lo largo de generaciones de selección a través del incremento de homocigotos. Las líneas maternales de conejo utilizadas en esta tesis, fueron utilizadas para generar un cruzamiento dialélico completo. Así, se generaron dieciséis grupos genéticos (cuatro líneas maternales y doce cruces simples). El objetivo de este experimento fue evaluar los caracteres reproductivos y la longevidad funcional de las hembras cruzadas y de las líneas puras. Los dieciséis grupos genéticos fueron distribuidos en cuatro granjas españolas, pero solo un grupo genético (línea V) estuvo presente en todas las granjas para conectar los datos entre estas y ser utilizada como grupo genético de referencia. Los datos de los caracteres reproductivos se obtuvieron desde septiembre de 2008 hasta el final de septiembre de 2011. Se estimaron las diferencias entre todos los grupos genéticos y la línea V. Así, las diferencias entre líneas para los efectos genéticos directos y maternos, y para el heterosis directa, se estimaron de acuerdo con el modelo de Dickerson. En lo concerniente a los componentes de tamaño de camada, en conejo y en otras especies ganaderas, se han realizado pocos estudios previos que pretendiesen estudiar los efectos del cruzamiento. El capítulo 5, se dedicó a estudiar la tasa de ovulación (OR), número de embriones implantados (EI), número total de nacidos (TB), número de nacidos vivos (NBA), supervivencia embrionaria (ES), supervivencia fetal (FS) y supervivencia prenatal (PS). Se utilizó un modelo animal. Las medias para todos los caracteres fueron mayores que las que se habían obtenido en estudios previos de estas mismas líneas. Las diferencias encontradas en OR y IE entre las líneas no resultaron significativas, a pesar que para la línea A los valores de OR resultaron menores y relevantes en comparación con las otras líneas. Por otra parte, las diferencias fueron significativas y relevantes para TB y NBA. En lo referente a las diferencias entre los diferentes cruces y la línea V, sólo se hallaron diferencias significativas a favor del cruce HxV. De forma general, el efecto positivo del cruzamiento en IE es debido principalmente a las menores pérdidas pre-implantacionales y las diferencias observadas no fueron suficientes para resultar significativas. En cuanto a TB y NBA, las diferencias obtenidas fueron importantes en dos casos: favorable en el caso de AxH y desfavorable para el caso de LPxV. En general, se encontraron diferencias relevantes, pero no siempre significativas, entre las líneas en los efectos genéticos directos. La línea LP presentó los mayores efectos genéticos directos con respecto a las otras líneas, siendo significativamente diferente en relación con la línea A. Las diferencias en los efectos maternos fueron no significativas, exceptuando las encontradas entre las líneas LP y V. Entre las líneas A y Hse encontró un efecto de heterosis grande y positivo. El cruce entre las líneas LP y V tuvo una heterosis negativa para todos los caracteres, con un efecto muy negativo en TB y NBA (16% y 11% de media respectivamente). En el capítulo 6, el objetivo fue analizar el tamaño de camada (nacidos totales (TB), número de nacidos vivos (NBA), número de destetados (NW) e intervalo entre partos (KI)). Solo la línea LP presentó un mayor efecto genético directo que la línea V, con un resultado significativo para NBA. Las otras líneas no mostraron diferencias significativas en los efectos genéticos directos y maternos para TB, NBA y NW pero hubo diferencias significativas para KI. Se estimó una heterosis grande y relevante para TB en el cruce HxV, seguido por los cruces AxH, AxV y LPxV. También se encontró una heterosis favorable y significativa para KI en los cruces AxV y LPxV, mientras que para los cruces AxLP y LPxH la heterosis fue significativa y desfavorable. Las conejas cruzadas, generalmente, mostraron un mayor nivel reproductivo en comparación con la línea V. Las diferencia entre la media conjunta de los cruces comparada con la línea V resultó importante, siendo 0.45 para TB, 0.57 para NBA, 0.75 para NW y -2.22 díaspara KI. El contraste entre cada dos líneas mostró un rendimiento similar y no encontramos diferencias significativas entre los efectos genéticos directos y maternos. El último capítulo de esta tesis tuvo como objetivo estudiar la longevidad funcional, definida como el número de días entre la primera palpación positiva y la muerte o eliminación de la coneja por razones ajenas a la producción. De este modo, la longevidad funcional representa la capacidad del animal para retrasar su eliminación involuntaria. Se analizaron los datos de 7,211 conejas mediante el Survival Kit 6.0, utilizando un modelo de Cox de efectos fijos y riesgos proporcionales. El modelo incorporó factores dependientes del tiempo, como el grupo-granja-año-estación (GFYS), el número de nacidos vivos (NBA), grupo-orden de palpación positiva (GPPO) y estado fisiológico de la hembra (PS). Las líneas A, H y V tuvieron una capacidad similar para evitar la eliminación, siendo más sensibles que la línea LP. La línea LP tuvo el menor riesgo asociado, con diferencias importantes a edades tardías y una probabilidad de ser remplazada de 0.39, 0.49 y 0.53 veces la tasa de sustitución de las líneas A, H, y V. No encontramos diferencias significativas entre los diferentes cruces y la línea V, excepto con el cruce entre AxH a favor de línea V. Las diferencias entre un cruce y su reciproco, generalmente, no fue significativa, excepto entre los cruces VxH y HxV, favorable a la HxV, y para los cruces LPxH y HxLP, a favor del HxLP. La línea V tuvo el mayor riesgo asociado debido a los efectos genéticos directos y estas diferencias fueron significativas con respecto a las líneas H y LP. Por otra parte, las diferencias en los efectos genéticos maternos fueron pequeños y no significativos, excepto en las líneas H y V, siendo favorables a la línea V. La estima de los efectos de heterosis no sigue la misma dirección pero mostraron, en algunos casos, la importancia de los cruces entre líneas especializadas para producir conejas cruzadas para la producción intensiva de conejos de carne. Así, se observó que en ciclos productivos tempranos, el riesgo asociado a las líneas puras es mayor que el riesgo asociado a los diferentes cruces, siendo este el periodo en el que todavía no se ha amortizado el coste de la coneja. Justamente lo contrario ocurre en ciclos productivos tardíos (5º ciclo o más), cuando el coste de la hembra ya ha sido amortizado. Algunos cruces como HxLP, HxV, AxV o VxA pueden ser especialmente recomendados para su uso en granjas comerciales. Parte de estas recomendaciones tienen en cuenta el hecho de que la adopción de gazapos después del nacimiento, hecho que valoriza los cruzamientos en que es alto el número de nacidos totales o nacidos vivos, pero no lo es tanto el número de destetados. También, el cruce AxH puede ser recomendado en granjas en las que los problemas de longevidad sean pequeños. XXXII Mohamed Ragab Resumen VI