RESUM La qualitat de l'aigua en els sistemes naturals i en particular en les aigües continentals influïx en la salut dels ecosistemes aquàtics així com en els diferents possibles usos del recurs hídric. Per un altre costat una adequada gestió dels recursos hídrics és un dels factors principals per a l'ús eficient de l'aigua i, en conseqüència, per a aconseguir un desenvolupament sostenible que proporcione un equilibri entre l'home i el medi ambient. Històricament ambdós conceptes, la qualitat i la gestió de l'aigua, han sigut tractats científica i administrativament de forma separada. Pocs són els desenvolupaments sobre simulació i optimització de sistemes de recursos hídrics que tenen en compte la qualitat de l'aigua. En la gestió dels recursos tan sols en moments en què la qualitat de l'aigua suposa un seriós limiten-te en la utilització del recurs es considera la seua importància i normalment com una reducció de la mateixa. En els últims anys hi ha un augment de la importància dels aspectes ambientals en la consciència social i en la legislació, com a reflexa l'última directiva europea sobre política d'aigües (UE, 2000). Açò té com a conseqüència que la gestió i la planificació dels recursos hídrics s'haja de realitzar, en un futur pròxim, davall els objectius d'eficiència i protecció de l'entorn. Per a això, ambdós matèries han de ser enteses com una sola i inseparable. En esta tesi doctoral s'ha desenvolupat un mòdul o ferramenta per a la modelació de la qualitat de sistemes de recursos hídrics. Esta ferramenta funciona en coordinació amb el Sistema Suport de Decisió (SSD) AQUATOOL, desenvolupat prèviament pel DIHMA de la Universitat Politècnica de València, per a la planificació i gestió de sistemes de recursos hídrics. El programa GESCAL permet la modelació de la major part dels constituents convencionals com són la temperatura, l'oxigen dissolt, el cicle del nitrogen, el fòsfor en les seues distintes formes, el fitoplàncton i altres contaminants arbitraris definits per l'usuari. Amb això l'usuari pot comprendre molts dels problemes actuals de la qualitat de l'aigua. La modelació de la qualitat es realitza tant en trams de riu com en embassaments, però es considera també la influència de la resta d'elements del sistema en què no es considera la modelació. Amb això es té una ferramenta que permet modelar de forma conjunta la gestió i la qualitat de sistemes de recursos hídrics. La validesa i utilitat del desenvolupament han sigut demostrades per mitjà de la seua aplicació a la conca del riu Xúquer. La simulació de diferents alternatives del model realitzat ha permés, entre altres coses, avaluar l'evolució de la qualitat en tot el sistema enfront de distints escenaris de distribució del recurs en la conca, analitzar l'efecte sobre la qualitat del sistema de futures infraestructures de depuració i estimar cabals de dilució per a la millora mediambiental en els punts crítics de la conca.