RESUMEN El cultivo de los cítricos representa la mayor producción de frutos en el mundo y España, en particular, ocupa una posición relevante siendo el quinto productor y primer exportador mundial de cítricos para su consumo en fresco. La obtención de variedades de alta calidad comercial y elevada producción, capaces de satisfacer las exigencias del mercado, constituye un objetivo esencial de la citricultura actual. El desarrollo vegetativo determina la forma y el comportamiento general de la planta, de modo que tiene una influencia decisiva en la cantidad y calidad del fruto, así como en las prácticas culturales. Sin embargo, el conocimiento de las señales que regulan el desarrollo vegetativo en cítricos es limitado. En este trabajo se han desarrollado nuevas herramientas de genómica funcional, en particular colecciones de ESTs y micromatrices de DNA, con las que hemos estudiado en detalle diversos aspectos del desarrollo vegetativo en cítricos. Mediante el análisis funcional de una colección de ESTs generada a partir de tejidos vegetativos hemos aislado los genes relacionados con la función principal de estos tejidos, la fotosíntesis. Adicionalmente, a partir de la colección de ESTs del Proyecto de Genómica Funcional de Cítricos (CFGP) hemos identificado genes implicados en el metabolismo de isoprenoides y flavonoides en cítricos. La mayoría de los genes de la biosíntesis de fitohormonas derivadas de isoprenoides, como giberelinas (GAs), brasinosteroides y ácido abscísico no habían sido aislados antes en cítricos. La identificación de los genes de biosíntesis de monoterpenos y sesquiterpenos, responsables del aroma tanto de las hojas como del fruto, ha mostrado que la familia de terpeno sintasas en cítricos es una de las más amplias y diversas en plantas. El análisis de la expresión génica mediante micromatrices de DNA nos ha permitido elaborar mapas de expresión génica en los tejidos reproductivos y en los tejidos vegetativos, incluida la raíz. Mediante estos mapas hemos podido comprender mejor las funciones de cada uno de los tejidos analizados. Finalmente, hemos estudiado la regulación del desarrollo vegetativo mediada por GAs mediante el análisis de la expresión génica de plantas transgénicas del patrón de cítricos citrange Carrizo que sobre-expresan el gen CcGA20ox1 (implicado en la biosíntesis de GAs). Los resultados muestran que la sobre-expresión de dicho gen conlleva una profunda modulación de la expresión génica. En concreto, hemos encontrado, por primera vez en plantas con un contenido elevado de GAs, una inducción global de los genes implicados en la fotosíntesis y en el ciclo de Calvin y una represión general de los genes relacionados con la síntesis de proteínas y con la biogénesis de ribosomas, lo que sugiere que dichos procesos están regulados por GAs. Además, hemos podido determinar que la activación transcripcional de los genes relacionados con la fotosíntesis conduce a un aumento de la capacidad de fijación fotosintética de CO2 de estas plantas. La expresión de genes que pertenecen a grupos funcionales no descritos previamente como grupos regulados por GAs (como estrés de origen biótico y abiótico o biosíntesis de la cutícula), así como de genes relacionados con la arquitectura de la pared celular se encuentra asimismo modificada en las plantas que sobre-expresan el gen CcGA20ox1. Las herramientas de genómica funcional generadas en este trabajo con su potencial para aislar genes de interés agronómico, para generar marcadores moleculares y para caracterizar colecciones de germoplasma, entre otros, podrían contribuir al desarrollo de nuevos cultivares de cítricos adaptados a las condiciones ambientales y cuya producción pueda satisfacer las características deseadas por los consumidores.