“Canvis d’expressió gènica associats a la resposta dels fruits cítrics contra la infecció per fongs del gènere Penicillium”
      La infecció produïda per P. digitatum y P italicum és una de les principals causes de pèrdues durant la postcollita de fruits cítrics. Els problemes derivats de l’aplicació de fungicides químics utilitzats en el seu control justifiquen la recerca d’alternatives eficaces. El coneixement de les bases de la interacció planta-patogen i els mecanismes de defensa de les plantes són fonamentals en el desenvolupament d’alternatives per al control de patologies vegetals. Fins l’actualitat, hi ha pocs estudis sobre el processos implicats en la resposta de defensa dels fruits contra la infecció per fongs fitopatògens.
      Durant el desenvolupament d’aquest treball hem emprat diferents aproximacions de genòmica funcional per a aprofondir en la resposta dels fruits cítrics a la infecció per fongs del gènere Penicillium. Hem elaborat dues biblioteques de cDNA: RindPdig24 s’obtingué de fruits de mandarina ‘Clemenules’ a les 24 hores després de ser ferits i infectats per P. digitatum, mentre que PostharvP1 s’obtingué de fruits de mandarina ‘Clemenules’ ferits i infectats per P. digitatum, a diferents temps, i està enriquida en cDNAs de longitud completa. Junt a elles, es va analitzar una tercera biblioteca subtractiva de cDNA elaborada prèviament, RindPdigS, enriquida en gens específics d’infecció de taronja ‘Navelina’. La seqüenciació massiva de clons d’estes tres biblioteques, la seua anotació i categorització funcional ha permés obtenir una representació global dels gens expressats en el fruit dels cítrics durant el procés d’infecció. Així, s’han seqüenciat un total de 2.505 clons diferents i identificat 1.941 unigens. Les dades s’han integrat en el Projecte Espanyol de Genòmica Funcional de Cítrics (CFGP). El 25% del total de clons no tenen homologia en les bases de dades públiques i el 26 % dels unigens no estan presents en cap altra biblioteca de cDNA del CFGP. Estes dades indiquen que la resposta del fruit cítric a la infecció presenta particularitats importants que mereixen un estudi detallat i que una part important de la mateixa és relativament desconeguda.
      Hem realitzat estudis d’expressió gènica a partir de l’ús, per una banda, d’una macromatriu que conté 1.436 clons seleccionats aleatòriament de RindPdigS i, d’altra banda, de la micromatriu 7K generada en el marc del CFGP i que conté 12.671 clons que corresponen a 6.333 unigens. La hibridació d’estes matrius ha permés caracteritzar el perfil global d’expressió en distints tractaments relacionats amb la infecció. S’han estudiat de manera més detallada els canvis d’expressió de gens individuals en resposta a la ferida o infecció per distints fongs del gènere Penicillium. L’anàlisi global dels resultats mostra de forma més rellevant un redireccionament del metabolisme general del fruit cítric durant la infecció cap a rutes del metabolisme secundari implicades en la síntesi de composts relacionats amb respostes de defensa, en especial de la família dels fenilpropanoides i alcaloides, identificant gens rellevants a partir de la seua abundància o nivell d’expressió. Estes seqüències gèniques enriqueixen notablement el repertori de gens implicats en la biosíntesi de distintes famílies de composts del metabolisme secundari. Així mateix, hem realitzat estudis encaminats a determinar la implicació de l’hormona vegetal etilé en la resposta de fruits cítrics a la infecció. Els resultats indiquen que encara que l’etilé és un mediador d’una part important de les respostes contra la infecció, es possible que existisquen altres mecanismes addicionals de regulació.