RESUMEN
El arroz (Oryza sativa L.) es el cultivo de mayor importancia por superficie cultivada y por ser la principal fuente de alimentación para más de la mitad de la población mundial. El requerimiento constante de aumentar su productividad conlleva importantes programas de mejora, tanto internacionales como locales. Con este estudio, integrado en el programa de Mejora del Departamento de Arroz del IVIA, se pretende ampliar el conocimiento sobre el control genético de varios caracteres en las condiciones de cultivo de la Comunidad Valenciana. Se han estudiado parámetros que puedan aportar una mayor resistencia al encamado, así como características de grano que se ajusten a los requisitos del mercado. Estos caracteres, como la mayoría de los de interés agronómico, son cuantitativos, y su estudio y selección se ven dificultados por su naturaleza poligénica y por estar altamente influenciados por el ambiente. Esta tesis se ha abordado desde dos perspectivas; por un lado, se ha realizado un análisis de la heredabilidad y eficacia de selección de estos caracteres, influencia del ambiente y correlaciones entre ellos; por otro lado, se ha estudiado el control genético mediante la identificación de los QTLs (loci que controlan los caracteres cuantitativos) que los determinan, sus efectos genéticos y la expresión en diferentes ambientes y poblaciones. Con ello se pretende mejorar la eficacia de la selección en la obtención de nuevas variedades, con el diseño de estrategias adaptadas a la mejora de cada carácter, y con la identificación QTLs apropiados para realizar selección asistida por marcadores (M.A.S.). 
El encamado es un accidente mecánico que provoca pérdidas en la calidad y la cantidad de la cosecha. Puesto que la resistencia al encamado no se puede determinar de manera directa en generaciones tempranas, se pretende determinar qué parámetros relacionados nos permitirían realizar una selección indirecta eficaz. Estudios previos han concluido que se puede aumentar la resistencia al encamado reduciendo el peso de la parte aérea, (principalmente, con líneas de menor estatura), así como aumentando el grosor del tallo (concretamente, de los entrenudos basales) y la resistencia al empuje. Sin embargo, la selección para algunos de estos caracteres puede llevar consigo la reducción de la productividad. Otros caracteres agronómicos que se han incluido en el estudio por su relación con el encamado son el porte y la fecha de maduración. Además, se han estudiado parámetros relacionados con la productividad (morfología de la hoja bandera, número y peso de las panículas y peso del grano) y con la calidad del grano (dimensiones y perlado). 
En este estudio se han analizado dos familias segregantes con un mismo parental femenino, pero con dos padres diferentes. La generación F2 se evaluó en dos ambientes (campo y balsetas) para analizar el efecto ambiental en los caracteres y en la expresión de los QTLs. Las correspondientes líneas F3 se evaluaron al año siguiente en un único ambiente. Tras aplicar selección para algunos caracteres, ésta fue efectiva para reducir la altura y aumentar el grosor y la longitud de los entrenudos basales en las dos poblaciones, y para incrementar del número de panículas y la resistencia al doblado sólo en una de ellas.
A partir del análisis con marcadores SSR y de los datos fenotípicos de las plantas F2 y de las líneas F3 de una de las poblaciones, se identificaron los QTLs implicados en los diversos caracteres. En muchos casos, se detectaron QTLs que afectan simultáneamente a varios caracteres y que coinciden con las correlaciones encontradas entre ellos. Se han localizado zonas de especial interés que podrían ser utilizadas para M.A.S.