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Browsing by Subject "Metagenomics"

Now showing items 1-20 of 25

Advances in plant virus evolution: translating evolutionary insights into better disease management

Acosta-Leal, R; Duffy, S; Xiong, Z; Hammond, R.W; Elena Fito, Santiago Fco (American Phytopathological Society, 2011-10)

[EN] Recent studies in plant virus evolution are revealing that genetic structure and behavior of virus and viroid populations can explain important pathogenic properties of these agents, such as host resistance breakdown, ...
Almond (Prunus dulcis) Bagasse as a Source of Bioactive Compounds with Antioxidant Properties: An In Vitro Assessment. Antioxidants

Duarte, Stevens; Puchades, Almudena; Jiménez-Hernández, Nuria; Betoret Valls, María Ester; Gosalbes, María José; Betoret Valls, Noelia (MDPI, 2023-06)

[EN] The presence of components of nutritional interest makes fresh almond bagasse an interesting by-product for obtaining functional ingredients. Stabilization through a dehydration process is an interesting option for ...
Caracterización fisicoquímica, tecnológica y funcional del residuo procedente de la obtención de la bebida vegetal de almendra. Estrategias de valorización.

Duarte Serna, Stevens (Universitat Politècnica de València, 2024-10-09)

[ES] El mercado de bebidas vegetales está experimentando un crecimiento constante debido a la creciente demanda de productos de origen vegetal. Dentro de este mercado, la bebida de almendra, perteneciente al grupo de las ...
Changes in the composition of the RNA virome mark evolutionary transitions in green plants

Mushegian, Arcady; Shipunov, Alexey; Elena Fito, Santiago Fco (BioMed Central, 2016-08-15)

Background: The known plant viruses mostly infect angiosperm hosts and have RNA or small DNA genomes. The only other lineage of green plants with a relatively well-studied virome, unicellular chlorophyte algae, is mostly ...
Consumo de alcohol y alteraciones en la composición de la microbiota intestinal: papel de los receptores del sistema inmunitario TLRs (Toll-Like receptors)

Rodríguez Navarro, Irene (Universitat Politècnica de València, 2020-10-07)

[ES] El alcohol es un compuesto neurotóxico causante del 5,3% de las muertes anuales. Un consumo excesivo de este afecta a un gran número de órganos y tejidos, especialmente el hígado, el sistema nervioso central (SNC) y ...
Creación de un pipeline para análisis de datos metagenómicos basado en Nextflow

Lomas Redondo, Alba (Universitat Politècnica de València, 2021-09-01)

[ES] La metagenómica es una disciplina que surge ante la imposibilidad de aislar y cultivar la (amplia) mayoría de los organismos microbianos que viven en los ecosistemas naturales. El término hace referencia al estudio ...
Dairy cattle ruminal resistome: characterisation and association with productive traits

López Catalina, Adrián (Universitat Politècnica de València, 2020-09-29)

[ES] El resistoma ruminal está compuesto por todos los genes de resistencia antimicrobiana (ARG) presentes en los microorganismos que habitan en el rumen. La Organización Mundial de la Salud advirtió sobre el problema de ...
Deep-Amplicon Sequencing (DAS) Analysis to Determine the Presence of Pathogenic Helicobacter species in Watewater Reused for Irrigation

Hortelano, Irene; Moreno Trigos, Mª Yolanda; Moreno-Mesonero, Laura; Ferrús Pérez, Mª Antonia (Elsevier, 2020-09)

[EN] Wastewater has become one of the most important and least expensive water for the agriculture sector. As an alternative to the overexploitation of water resources. Inappropriate treatment before reuse can result in a ...
Determinación del riesgo para el consumidor de la presencia de H. pylori y otros Helicobacter spp. patógenos en aguas de consumo mediante técnicas moleculares y metagenómica

Hortelano Martín, Irene (Universitat Politècnica de València, 2021-12-27)

[ES] De entre los patógenos emergentes presentes en agua, las bacterias del género Helicobacter son de las más alarmantes, ya que se encuentran directamente relacionadas con el cáncer gástrico y hepatobiliar y su epidemiología ...
Diseño y adaptación de herramientas de visualización de grafos de anotación en metagenoma

Lyeuta Tykhovod, Vladyslav (Universitat Politècnica de València, 2016-09-07)

[ES] Gracias al desarrollo de las tecnologías, los campos dentro de la Bioinformática se ven favorecidos al aumentar la cantidad de datos experimentales con los que pueden trabajar. El problema aparece cuando se intenta ...
Effect of swabbing cleaning method on biofilm communities of a drinking water distribution system in Madrid (Spain)

Calero Preciado, Carolina; Rodríguez Ruiz, Emelina; Arias Guedón, Manuel (Editorial Universitat Politècnica de València, 2024-03-06)

[EN] Drinking Water Distribution Systems (DWDS) are complex engineering networks where it has been shown that the microbial presence plays a key role for the drinking water quality and safety. Most of microbial biomass in ...
Estudio de las poblaciones bacterianas en biofilms de sistemas de distribución de agua potable mediante metagenómica

Moreno Trigos, Mª Yolanda; Moreno-Mesonero, Laura; Soriano Ponce, Adela; Macián Cervera, Vicente Javier (Infoedita, 2019-06)

[ES] En este trabajo se ha llevado a cabo un estudio del microbioma bacteriano de los biofilms presentes en las tuberías del sistema de distribución de agua potable de Valencia mediante la aplicación de metagenómica de ...
Evidence of viable Helicobacter pylori and other bacteria of public health interest associated with free-living amoeba in lettuce samples by next generation sequencing and other molecular techniques

Moreno-Mesonero, Laura; Hortelano, Irene; Moreno Trigos, Mª Yolanda; Ferrús Pérez, Mª Antonia (Elsevier, 2020-04-02)

[EN] Vegetables are one of the sources from which Helicobacter pylori can be acquired. This bacterium infects > 50% of the global population and is a recognized type I human carcinogen. H. pylori enters into the viable but ...
Identification of Complex Rumen Microbiome Interaction Within Diverse Functional Niches as Mechanisms Affecting the Variation of Methane Emissions in Bovine

Martínez-Álvaro, Marina; Auffret, Marc D.; Stewart, Robert D.; Dewhurst, Richard J.; Duthie, Carol-Anne; Rooke, John A.; Wallace, R. John; Shih, Barbara; Freeman, Tom C.; Watson, Mick; Roehe, Rainer (Frontiers Media SA, 2020-04-17)

[EN] A network analysis including relative abundances of all ruminal microbial genera (archaea, bacteria, fungi, and protists) and their genes was performed to improve our understanding of how the interactions within the ...
Including metagenomic analysis in Blast2GO

Pérez García, José Antonio (Universitat Politècnica de València, 2018-09-19)

[EN] Bioinformatics is a discipline that is increasingly prevalent nowadays, its objective is the management and treatment, at a computational and statistical level, of biological or medical data. Within this area is ...
Influence of the metagenome on resistance to stress and diseases in rabbits

Belloumi, Dhekra (Universitat Politècnica de València, 2020-10-01)

[ES] En los últimos años, la varianza ambiental ha despertado un gran interés en la mejora genética animal. La varianza ambiental se ha relacionado con la capacidad del animal para adaptarse a nuevos desafíos ambientales, ...
Intramuscular Fat Deposition in Rabbits: Insights into Host-Microbiome Biological Mechanisms

Zubiri Gaitán, Agostina (Universitat Politècnica de València, 2025-01-30)

[ES] El objetivo de la Tesis fue investigar los mecanismos genéticamente determinados involucrados en la deposición de grasa intramuscular (GIM) usando 2 líneas divergentes de GIM (A y B) en el músculo Longissimus thoracis ...
Long-read, error prone metagenomics: Systematic evaluation of assembly tools for nanopore sequencing

Blanot, Morgane (Universitat Politècnica de València, 2020-09-25)

[EN] Microorganisms can produce a wide variety of compounds and are key factors for understanding the behavior of ecological systems. Metagenomics is the tool for achieving this knowledge, studying microorganisms directly ...
Metagenomic analysis of viruses, bacteria and protozoa in irrigation water

Rusiñol, Marta; Martinez-Puchol, Sandra; Timoneda, Natalia; Fernandez-Cassi, Xavier; Pérez-Cataluña, A.; Fernández-Bravo, A.; Moreno-Mesonero, Laura; Moreno Trigos, Mª Yolanda; Alonso Molina, José Luís; Figueras, M.J.; Abril, J.F.; Bofill-Mas, S.; Gironés, R. (Elsevier, 2020-03)

[EN] Viruses (e.g., noroviruses and hepatitis A and E virus), bacteria (e.g., Salmonella spp. and pathogenic Escherichia coli) and protozoa (e.g., Cryptosporidium parvum and Giardia intestinalis) are well-known contributors ...
Metagenómica comparativa de muestras ambientales de biofilms

Izquierdo Altarejos, Paula (Universitat Politècnica de València, 2015-10-21)

[ES] Los objetivos principales del trabajo son analizar la población bacteriana presente en muestras ambientales de biofilms y comparar los resultados obtenidos mediante tres técnicas: secuenciación de metagenomas completos ...