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Browsing by Subject "Metagenomics"

Now showing items 1-17 of 17

Advances in plant virus evolution: translating evolutionary insights into better disease management

Acosta-Leal, R; Duffy, S; Xiong, Z; Hammond, R.W; Elena Fito, Santiago Fco (American Phytopathological Society, 2011-10)

[EN] Recent studies in plant virus evolution are revealing that genetic structure and behavior of virus and viroid populations can explain important pathogenic properties of these agents, such as host resistance breakdown, ...
Changes in the composition of the RNA virome mark evolutionary transitions in green plants

Mushegian, Arcady; Shipunov, Alexey; Elena Fito, Santiago Fco (BioMed Central, 2016-08-15)

Background: The known plant viruses mostly infect angiosperm hosts and have RNA or small DNA genomes. The only other lineage of green plants with a relatively well-studied virome, unicellular chlorophyte algae, is mostly ...
Consumo de alcohol y alteraciones en la composición de la microbiota intestinal: papel de los receptores del sistema inmunitario TLRs (Toll-Like receptors)

Rodríguez Navarro, Irene (Universitat Politècnica de València, 2020-10-07)

[ES] El alcohol es un compuesto neurotóxico causante del 5,3% de las muertes anuales. Un consumo excesivo de este afecta a un gran número de órganos y tejidos, especialmente el hígado, el sistema nervioso central (SNC) y ...
Creación de un pipeline para análisis de datos metagenómicos basado en Nextflow

Lomas Redondo, Alba (Universitat Politècnica de València, 2021-09-01)

[ES] La metagenómica es una disciplina que surge ante la imposibilidad de aislar y cultivar la (amplia) mayoría de los organismos microbianos que viven en los ecosistemas naturales. El término hace referencia al estudio ...
Dairy cattle ruminal resistome: characterisation and association with productive traits

López Catalina, Adrián (Universitat Politècnica de València, 2020-09-29)

[ES] El resistoma ruminal está compuesto por todos los genes de resistencia antimicrobiana (ARG) presentes en los microorganismos que habitan en el rumen. La Organización Mundial de la Salud advirtió sobre el problema de ...
Deep-Amplicon Sequencing (DAS) Analysis to Determine the Presence of Pathogenic Helicobacter species in Watewater Reused for Irrigation

Hortelano, Irene; Moreno Trigos, Mª Yolanda; Moreno-Mesonero, Laura; Ferrús Pérez, Mª Antonia (Elsevier, 2020-09)

[EN] Wastewater has become one of the most important and least expensive water for the agriculture sector. As an alternative to the overexploitation of water resources. Inappropriate treatment before reuse can result in a ...
Determinación del riesgo para el consumidor de la presencia de H. pylori y otros Helicobacter spp. patógenos en aguas de consumo mediante técnicas moleculares y metagenómica

Hortelano Martín, Irene (Universitat Politècnica de València, 2021-12-27)

[ES] De entre los patógenos emergentes presentes en agua, las bacterias del género Helicobacter son de las más alarmantes, ya que se encuentran directamente relacionadas con el cáncer gástrico y hepatobiliar y su epidemiología ...
Diseño y adaptación de herramientas de visualización de grafos de anotación en metagenoma

Lyeuta Tykhovod, Vladyslav (Universitat Politècnica de València, 2016-09-07)

[ES] Gracias al desarrollo de las tecnologías, los campos dentro de la Bioinformática se ven favorecidos al aumentar la cantidad de datos experimentales con los que pueden trabajar. El problema aparece cuando se intenta ...
Estudio de las poblaciones bacterianas en biofilms de sistemas de distribución de agua potable mediante metagenómica

Moreno Trigos, Mª Yolanda; Moreno-Mesonero, Laura; Soriano Ponce, Adela; Macián Cervera, Vicente Javier (Infoedita, 2019-06)

[ES] En este trabajo se ha llevado a cabo un estudio del microbioma bacteriano de los biofilms presentes en las tuberías del sistema de distribución de agua potable de Valencia mediante la aplicación de metagenómica de ...
Including metagenomic analysis in Blast2GO

Pérez García, José Antonio (Universitat Politècnica de València, 2018-09-19)

[EN] Bioinformatics is a discipline that is increasingly prevalent nowadays, its objective is the management and treatment, at a computational and statistical level, of biological or medical data. Within this area is ...
Long-read, error prone metagenomics: Systematic evaluation of assembly tools for nanopore sequencing

Blanot, Morgane (Universitat Politècnica de València, 2020-09-25)

[EN] Microorganisms can produce a wide variety of compounds and are key factors for understanding the behavior of ecological systems. Metagenomics is the tool for achieving this knowledge, studying microorganisms directly ...
Metagenomic analysis of viruses, bacteria and protozoa in irrigation water

Rusiñol, Marta; Martinez-Puchol, Sandra; Timoneda, Natalia; Fernandez-Cassi, Xavier; Pérez-Cataluña, A.; Fernández-Bravo, A.; Moreno-Mesonero, Laura; Moreno Trigos, Mª Yolanda; Alonso Molina, José Luís; Figueras, M.J.; Abril, J.F.; Bofill-Mas, S.; Gironés, R. (Elsevier, 2020-03)

[EN] Viruses (e.g., noroviruses and hepatitis A and E virus), bacteria (e.g., Salmonella spp. and pathogenic Escherichia coli) and protozoa (e.g., Cryptosporidium parvum and Giardia intestinalis) are well-known contributors ...
Metagenómica comparativa de muestras ambientales de biofilms

Izquierdo Altarejos, Paula (Universitat Politècnica de València, 2015-10-21)

[ES] Los objetivos principales del trabajo son analizar la población bacteriana presente en muestras ambientales de biofilms y comparar los resultados obtenidos mediante tres técnicas: secuenciación de metagenomas completos ...
Microbioma de amebas de vida libre (FLA) presentes en alimentos orgánicos: ¿potencial riesgo para la Salud Pública?

Gajas Priego, Sara María (Universitat Politècnica de València, 2021-09-07)

[ES] Actualmente, existe un interés creciente en la producción agrícola orgánica en todo el mundo, en busca de la sostenibilidad y la mejora de la salud pública. Sin embargo, existe un vacío de conocimiento sobre algunos ...
Multiple identification of most important waterborne protozoa in surface water used for irrigation purposes by 18S rRNA amplicon-based metagenomics

Moreno Trigos, Mª Yolanda; Moreno-Mesonero, Laura; Amoros, Inmaculada; Pérez-Santonja, Rut; Morillo, J.A.; Alonso Molina, José Luís (Elsevier, 2018)

[EN] Understanding waterborne protozoan parasites (WPPs) diversity has important implications in public health. In this study, we evaluated a NGS-based method as a detection approach to identify simultaneously most important ...
Resistencias a antibióticos en ejemplares de Blatella germanica

Morote Faubel, Mireya (Universitat Politècnica de València, 2015-09-07)

[ES] El uso de antibióticos y antimicrobianos tan expandido es uno de los factores que propia la aparición de microorganismos multirresistentes, entre los que se incluyen diversas clases de patógenos. En este proyecto ...
Valorisation of Persimmon and Blueberry By-Products to Obtain Functional Powders: in vitro Digestion and Fermentation by Gut Microbiota

Bas-Bellver, Claudia; Andrés, Cristina; Seguí Gil, Lucía; Barrera Puigdollers, Cristina; Jiménez-Hernández, Nuria; Artacho, Alejandro; Betoret Valls, Noelia; Gosalbes, María José (American Chemical Society, 2020-07-29)

[EN] Globalization of fruit and vegetable markets generates overproduction, surpluses, and potentially valuable residues. The valorization of these byproducts constitutes a challenge, to ensure sustainability and reintroduce ...