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Browsing by Subject "Transcriptomics"

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A meta-analysis reveals the commonalities and differences in Arabidopsis thaliana response to different viral pathogens

Rodrigo Tarrega, Guillermo; Carrera Montesinos, Javier; Ruiz-Ferrer, Virginia; Del Toro, F.J.; Llave, C; Voinnet, O.; Elena Fito, Santiago Fco (Public Library of Science, 2012-07)

Understanding the mechanisms by which plants trigger host defenses in response to viruses has been a challenging problem owing to the multiplicity of factors and complexity of interactions involved. The advent of genomic ...
Abordajes Bioinformáticos para la Integración Funcional de Datos Transcriptómicos en Biomedicina

Alandes Esteve, Sandra (Universitat Politècnica de València, 2017-09-04)

The high throughput techniques such as microarrays and sequencing have boosted transcriptomic studies as approaches of interest in the biomedical areas. Its use has generated a large volume of biological information, ...
Análisis de datos ómicos para determinar diferencias entre nacimientos prematuros y a término a partir de exosomas de leche materna

Porlán Miñarro, Antonio (Universitat Politècnica de València, 2021-10-08)

[ES] El parto prematuro está asociado a resultados adversos en el desarrollo del neonato. En este aspecto, la leche materna y su composición juegan un papel importante en el correcto desarrollo del neonato, ya que es un ...
Análisis de la expresión diferencial de miRNA y de mRNA en pacientes enfermos con carcinoma de células renales

Debesa Tur, Gabriela Belén (Universitat Politècnica de València, 2016-11-03)

[EN] The causes of the development and evolution of cancerous processes are still unclear among the scientific community; there is no deep understanding of this illness yet, due to its high complexity and multifactorial ...
Análisis transcriptómico del espliceosoma en tejido cardíaco de pacientes con insuficiencia cardiaca. Relación con la función ventricular

Botey Bataller, Francisco Javier (Universitat Politècnica de València, 2019-09-03)

[ES] La insuficiencia cardiaca (IC) es un síndrome multifactorial cuya incidencia y prevalencia han aumentado en los últimos años. Sus principales etiologías, la miocardiopatía isquémica y la miocardiopatía dilatada aún ...
Caracterización de las diferencias de sexo en esclerosis múltiple, mediante la revisión sistemática y metaanálisis de estudios transcriptómicos a nivel de microRNAs

Muñoz del Campo, Ester (Universitat Politècnica de València, 2022-07-13)

[ES] La esclerosis múltiple es una enfermedad que conlleva la desmielinización y neurodegeneración del sistema nervioso central. Sus síntomas presentan variaciones en cuanto al inicio, progreso y manifestaciones clínicas ...
Caracterización de las diferencias de sexo en las enfermedades cerebrovasculares mediante el metaanálisis de estudios transcriptómicos

Hamdani el Amri, Yassir el (Universitat Politècnica de València, 2021-09-02)

[ES] Los accidentes cerebrovasculares son la consecuencia de la interrupción del suministro del flujo sanguíneo a una parte del cerebro, desencadenando una hipoxia cerebral y, por consiguiente, la muerte neuronal. Según ...
Cell Wall Remodeling in Abscission Zone Cells during Ethylene-Promoted Fruit Abscission in Citrus

Merelo, P.; Agusti, J.; Arbona, V.; Costa, M.L.; Hueso Estornell, Leandro; Gómez-Cadenas, Aurelio; Coimbra, S.; Gómez Jiménez, Maria Dolores; Perez Amador, Miguel Angel; Domingo, C.; Talón, M.; Tadeo, F.R. (Frontiers Media SA, 2017-02-08)

[EN] Abscission is a cell separation process by which plants can shed organs such as fruits, leaves, or flowers. The process takes place in specific locations termed abscission zones. In fruit crops like citrus, fruit ...
Comparative Transcriptome Profile between Iberian Pig Varieties Provides New Insights into Their Distinct Fat Deposition and Fatty Acids Content

Villaplana-Velasco, Ana; Noguera, Jose Luis; Pena, Ramona Natacha; Ballester, Maria; Muñoz, Lourdes; González, Elena; Tejeda, Juan Florencio; Ibáñez-Escriche, Noelia (MDPI AG, 2021-03)

[EN] Iberian pigs are meat quality models due to their high fat content, high intramuscular fat, and oleic fatty acid composition. These parameters present great variability and are differentiated among the lines that make ...
De novo assembly of Phlomis purpurea after challenging with Phytophthora cinnamomi

Baldé, A.; Neves, D.; García-Breijo, Francisco-José; Pais, M. S.; Cravador, A. (Springer (Biomed Central Ltd.), 2017)

[EN] Background: Phlomis plants are a source of biological active substances with potential applications in the control of phytopathogens. Phlomis purpurea (Lamiaceae) is autochthonous of southern Iberian Peninsula and ...
Detección precoz de señales marcadoras de transiciones de estado sano a enfermo durante la infección de Nicotiana tabacum con el virus del grabado del tabaco

Tarazona Sánchez, Adrián (Universitat Politècnica de València, 2019-10-01)

[EN] In recent years the study of complex biological systems has changed in a radical way. This change has been promoted by two important breakthroughs. On the one hand, advances in high-throughput molecular biology that ...
Development of a bioinformatics approach for the functional analysis of alternative splicing

Fuente Lorente, Lorena de la (Universitat Politècnica de València, 2019-09-02)

[ES] Uno de los aspectos más apasionantes de la transcripción es la plasticidad transcriptómica y proteómica mediada por los procesos de regulación post-transcripcional (PTR). Los mecanismos PTR como el splicing alternativo ...
Development of bioinformatic tools for massive sequencing analysis

Furió Tarí, Pedro (Universitat Politècnica de València, 2020-10-19)

[EN] Transcriptomics is one of the most important and relevant areas of bioinformatics. It allows detecting the genes that are expressed at a particular moment in time to explore the relation between genotype and phenotype. ...
Differential expression in RNA-seq: A matter of depth

Tarazona Campos, Sonia; García-Alcalde, Fernando; Dopazo, Joaquín; Ferrer Riquelme, Alberto José; Conesa, Ana (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2011-09-08)

Next-generation sequencing (NGS) technologies are revolutionizing genome research, and in particular, their application to transcriptomics (RNA-seq) is increasingly being used for gene expression profiling as a replacement ...
Evaluation and improvement of quality control methods for long read-defined transcriptomes

Estevan Morió, Eva (Universitat Politècnica de València, 2022-09-06)

[ES] Las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento de transcriptomas mediante lecturas largas han facilitado el descubrimiento de nuevos transcritos. No obstante, dichas tecnologías tienen una tasa de error muy ...
Integration of multi-omics data to describe link between developmental exposure to pesticides and impaired neurodevelopment

Bernabeu Gómez, Elena (Universitat Politècnica de València, 2016-07-28)

[EN] In recent years the omics disciplines have made their way across a wider spectrum of research groups, thus leading to the generation of multi-omics data sets in a great number of studies. While traditional omics ...
Multi-omic data integration study of immune system alterations in the development of minimal hepatic encephalopathy in patients with liver cirrhosis

Rubio Martínez-Abarca, María Teresa (Universitat Politècnica de València, 2022-09-01)

[ES] El objetivo principal de este trabajo fue conocer las alteraciones inmunológicas asociadas a la inflamación periférica que desencadenan deterioro cognitivo en los pacientes cirróticos encefalopatía hepática mínima ...
Optimización, validación y aplicación a un caso real de una herramienta bioinformática para el análisis transcriptómico de organismos no modelo utilizando lecturas largas

Sobrino Sánchez, Isidro (Universitat Politècnica de València, 2022-10-21)

[ES] El desarrollo de las tecnologías de secuenciación de lectura larga como Pacific Bioscience (PacBio) o Oxford Nanopore han permitido un enorme avance en la secuenciación, no solo de genomas, sino también de ARN mensajero. ...
Statistical methods for transcriptomics: From microarrays to RNA-seq

Tarazona Campos, Sonia (Universitat Politècnica de València, 2015-03-30)

La transcriptómica estudia el nivel de expresión de los genes en distintas condiciones experimentales para tratar de identificar los genes asociados a un fenotipo dado así como las relaciones de regulación entre distintos ...
Transcriptome characterization and high throughput SSRs and SNPs discovery in Cucurbita pepo (Cucurbitaceae)

Blanca Postigo, José Miguel; Cañizares Sales, Joaquín; Roig Montaner, Mª Cristina; Ziarsolo Areitioaurtena, Pello; Nuez Viñals, Fernando; Picó Sirvent, María Belén (BioMed Central, 2011)

Background: Cucurbita pepo belongs to the Cucurbitaceae family. The "Zucchini" types rank among the highest-valued vegetables worldwide, and other C. pepo and related Cucurbita spp., are food staples and rich sources of ...