HPG Aligner applies suffix arrays for DNA read mapping. This implementation produces a highly sensitive and extremely fast mapping of DNA reads that scales up almost linearly with read length. The approach presented here ...
Diez Alba, Carlos(Universitat Politècnica de València, 2016-09-05)
[ES] Mediante este proyecto se plantea el diseño de un analizador de biosecuencias
centrado en el análisis de la elongación en horquilla (hairpin lengthening), una
operación natural sobre lenguajes formales inspirada en ...
Villar Lafuente, Carlos José(Universitat Politècnica de València, 2016-09-07)
[ES] En el presente TFG se desarrollará un analizador de secuencias de carácter bioquímico (fundamentalmente, secuencias de ADN y de ARN) para la búsqueda de posibles mutaciones debidas a la repetición de subsecuencias. ...
Rangel, Ezequiel; Alfaro Fernández, Ana Olvido; Font San Ambrosio, Maria Isabel; Luis-Arteaga, M.; Rubio, Luis(Springer Verlag (Germany), 2011-12)
[EN] Tomato mosaic virus (ToMV), a member of the genus Tobamovirus, infects several ornamental and horticultural crops worldwide. In this study, the nucleotide sequences of the coat protein gene of worldwide ToMV isolates ...
Cuesta Amat, Gonzalo; García de la Fuente, Rosana; Abad Berjón, Manuel; Fornes Sebastiá, Fernando(Elsevier, 2012-03)
The search for new biocontrol strategies to inhibit the growth of phytopathogenic microorganisms has become widely widespread due to environmental concerns. Among actinomycetes, Streptomyces species have been extensively ...
Llorens, Carlos; Futami, Ricardo; Covelli, Laura; Domínguez-Escriba, Laura; Viu, Jose M.; Tamarit, Daniel; Aguilar-Rodríguez, Jose; Vicente Ripollés, Miguel; Fuster, Gonzalo; Bernet, Guillermo P; Maumus, Florian; Munoz-Pomer, Alfonso; Sempere Luna, José María; Latorre, Amparo; Moya, Andres(Oxford University Press (OUP): Policy C - Option B, 2011)
This article introduces the second release of the Gypsy Database of Mobile Genetic Elements (GyDB 2.0): a research project devoted to the evolutionary dynamics of viruses and transposable elements based on their phylogenetic ...