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Inexact Mapping of Short Biological Sequences in High Performance Computational Environments

Salavert Torres, José (Universitat Politècnica de València, 2014-10-30)

La bioinformática es la aplicación de las ciencias computacionales a la gestión y análisis de datos biológicos. A partir de 2005, con la aparición de los secuenciadores de ADN de nueva generación surge lo que se conoce ...
Pair-end inexact mapping on hybrid GPU environments and out-of-core indexes

Salavert Torres, José; Tomás Domínguez, Andrés Enrique; Medina Castelló, Ignacio; Sadakane, Kunihiko; Blanquer Espert, Ignacio (Bentham Science Publishers, 2016)

[EN] Due to the NGS data deluge, sequence mapping has become an intensive task that, depending on the experiment, may demand high amounts of computing power or memory capacity. On the one hand, GPGPU architectures have ...

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