Introducción alas nuevas tecnologías: MinION, secuenciación en tiempo real

Abstract

Desde el descubrimiento de la estructura del ácido desoxirribonucleico (ADN) por Watson, Crick y Franklin en 1953, la comunidad científica ha realizado continuos esfuerzos para secuenciar el ADN. La primera tecnología de Sanger era increíblemente precisa, pero requería mucho tiempo de preparación, lo que aumentaba el coste del proceso y de los secuenciadores. Sin embargo, la secuenciación del ADN ha avanzado mucho desde Sanger. Las tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS) consiguieron reducir drásticamente el coste del procesado y aumentaron el rendimiento por muestra, pero no el coste de los secuenciadores. En este sentido, la secuenciación genómica de tercera generación Nanopore ha revolucionado el mercado debido a su bajo coste, alta repetibilidad y facilidad de preparación de muestras. En especial, el secuenciador MinION desarrollado por Oxford Nanopore Technologies es un dispositivo económico, portátil y de mecanismo sencillo para la secuenciación de ADN en tiempo real. En este artículo proponemos un modelo que une conceptos experimentales y bioinformáticos utilizando el MinION para determinar el perfil microbiano de diferentes muestras de suelo gracias a las regiones conservadas y variables del gen ARNr 16S.