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Estudio de regiones genómicas asociadas a la varianza ambiental del tamaño de camada en conejos

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Estudio de regiones genómicas asociadas a la varianza ambiental del tamaño de camada en conejos

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dc.contributor.advisor Ibáñez Escriche, Noelia es_ES
dc.contributor.author Casto Rebollo, Cristina es_ES
dc.date.accessioned 2018-09-10T07:26:19Z
dc.date.available 2018-09-10T07:26:19Z
dc.date.created 2018-07-13 es_ES
dc.date.issued 2018-09-10 es_ES
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10251/106833
dc.description.abstract En los últimos años ha habido un creciente interés por estudiar el control genético de la varianza ambiental (Ve) en el campo de la mejora genética animal. La posibilidad de reducir la Ve por selección unido a su relación con la sensibilidad ambiental permite aumentar la capacidad de los animales para hacer frente a cambios en las condiciones ambientales. Un experimento de selección divergente en conejos para Ve del tamaño de camada (TC) durante 12 generaciones fue realizado por la Universidad Miguel Hernández de Elche. En estas líneas se observó que las hembras pertenecientes a la línea para baja Ve del TC toleraban de una forma más eficiente los factores de estrés externos, comparado con la línea para alta Ve del TC. Sin embargo, no se conocen los genes y rutas que podrían estar regulando la Ve del TC. El objetivo de este estudio fue identificar regiones genómicas asociadas a Ve del TC. Para ello se procedió a genotipar 288 hembras pertenecientes a las líneas de alta (149) y baja (139) Ve del TC de las generaciones 11 y 12 usando el chip de Affymetrix Axiom OrCunSNP. La Ve se calculó, tras la pre-corrección del tamaño de camada por los efectos año estación y tres niveles de parto-lactación, como la variación del tamaño de camada dentro de hembra. Los análisis de asociación se realizaron utilizando dos metodologías diferentes: (a) asociación marcador por marcador incluyendo en el modelo la matriz de relaciones de parentesco genómicas (GRM) construida excluyendo el cromosoma donde se encuentra el SNP a testar y (b) método de regresión con múltiples marcadores considerando la línea como efecto fijo y asumiendo un valor de ¿=0.9997. Por ambos métodos se identificaron tres regiones genómicas localizadas en los cromosomas 1, 3 y 14. En estas regiones, siete genes fueron seleccionados como genes candidatos (CAT, DOCK2, LCP2, SLIT3, ST3GAL6, LMO2, GPR15 y CD59). La mayoría de las funciones de estos genes están relacionadas con procesos inmunológicos involucrados en la respuesta inflamatoria como la formación de ligandos de selectinas, la activación del sistema del complemento, la inducción de la migración leucocitaria y la reducción de especies reactivas del oxígeno. De igual forma, también se realizaron estudios de asociación sobre caracteres con respuesta correlacionada a la selección por Ve del TC como el tamaño de camada, el número de embriones implantados (EI), la tasa de ovulación (TO) y la supervivencia embrionaria (ES) y fetal (FS). En estos estudios se identificaron regiones genómicas asociadas en todos los caracteres exceptuando la TO. De todos los genes identificados destacan el gen ZP1 y el gen VEGFC, asociado al carácter EI y ES y al TC, respectivamente. ZP1 está relacionado con el mantenimiento de la integridad de la zona pelúcida del ovocito y VEGFC con la angiogénesis durante el desarrollo embrionario. Los resultados obtenidos en este estudio sugieren que la selección por Ve modificaría las frecuencias alélicas de genes involucrados en la respuesta inmunológica. Estos resultados apoyarían la hipótesis de que se puede modificar la susceptibilidad de los animales al ambiente a través de la selección de Ve del TC. Además, los resultados también indicarían que la selección por Ve del TC puede influenciar genes que afecten el rendimiento en caracteres reproductivos como TC, EI, ES y FS. es_ES
dc.language Español
dc.publisher Universitat Politècnica de València es_ES
dc.rights Reserva de todos los derechos es_ES
dc.subject varianza ambiental es_ES
dc.subject sensibilidad ambiental es_ES
dc.subject procesos inmunológicos es_ES
dc.subject genómica es_ES
dc.subject conejo. es_ES
dc.subject environmental variance en_EN
dc.subject environmental sensitivity en_EN
dc.subject immunological process en_EN
dc.subject genomic en_EN
dc.subject rabbit. en_EN
dc.subject.classification PRODUCCION ANIMAL es_ES
dc.subject.other Máster Universitario en Mejora Genética Animal y Biotecnología de la Reproducción-Màster Universitari en Millora Genètica Animal i Biotecnologia de la Reproducció es_ES
dc.title Estudio de regiones genómicas asociadas a la varianza ambiental del tamaño de camada en conejos es_ES
dc.type Tesis de máster es_ES
dc.rights.accessRights Abierto es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Departamento de Ciencia Animal - Departament de Ciència Animal es_ES
dc.description.bibliographicCitation Casto Rebollo, C. (2018). Estudio de regiones genómicas asociadas a la varianza ambiental del tamaño de camada en conejos. http://hdl.handle.net/10251/106833 es_ES
dc.description.accrualMethod TFGM es_ES
dc.relation.pasarela TFGM\92419 es_ES


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