Composición de microbiota intestinal de la población valenciana nativa y la simulada en el sistema de digestión ex vivo, MiniARIS

Abstract

[ES] El tracto gastrointestinal humano alberga una población compleja y dinámica de microorganismos, conocida como microbiota intestinal. La microbiota tiene un papel funcional relevante, directa o indirectamente, en el adecuado funcionamiento de la fisiología humana. Es destacable el papel fundamental que la microbiota tiene en la digestión de los alimentos y la nutrición. La necesidad de comprender estos procesos llevó a los investigadores del Centro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco (CIATEJ) en México a desarrollar una tecnología que simula el tracto gastrointestinal humano en cinco biorreactores, correspondientes al estómago, intestino delgado e intestino grueso. Esta tecnología, conocida como ARIS (Automated and Robotic Intestinal System) se adapta a la población de estudio ya que utiliza la microbiota humana nativa, proveniente de donantes, como fuente de microbiota y es, por lo tanto, un sistema ex vivo. En el presente trabajo se compara la microbiota de una cohorte de personas de la ciudad de València con la establecida en el digestor a partir de la primera. Se ha determinado la composición de las microbiotas anteriores mediante técnicas de secuenciación masiva y comparado sus diversidades ¿ y ß, tanto en bacterias como en hongos. Aunque los resultados obtenidos muestran que no se ha conseguido emular la microbiota de la población valenciana en el digestor ARIS, que muestra una diversidad menor, se ha podido determinar donde radican los problemas con el prototipo de digestor, y sentado las bases para su adecuada resolución.

[EN] The human gastrointestinal tract has a complex and dynamic population of microorganisms, known as intestinal microbiota. The microbiota has a relevant functional role, direct or indirect, in the correct functioning of human physiology. It is remarkable the fundamental role of the microbiota in the digestion of food and nutrition. The need to understand those processes led researches of the Centro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco (CIATEJ), México to develop a technology that simulates the human gastrointestinal tract in five bioreactors, corresponding to the stomach, small intestine and large intestine. This technology, known as ARIS (Automated and Robotic Intestinal System) is adapted to the study population, since it uses the native human microbiota, from donors as a source of microbiota. Therefore, ARIS is an ex vivo system. In this work, the microbiota of a cohort of people from the city of Valencia is compared to the one established on the digestor based on it. The composition of the microbiota has been determined by NGS techniques, and the ¿ and ß diversities of bacteria and fungi have been compared in both microbiotas. Although the results show that the microbiota of the Valencian population has not been established on ARIS because it has a lower diversity. We have been able to determine where the problems with the digestor prototype were and to set the bases for its adequate resolution.