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FaST-LMM for two-way Epistasis tests on high performance clusters

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FaST-LMM for two-way Epistasis tests on high performance clusters

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Martínez, H.; Barrachina, S.; Castillo, M.; Quintana Ortí, ES.; Rambla De Argila, J.; Farre, X.; Navarro, A. (2018). FaST-LMM for two-way Epistasis tests on high performance clusters. Journal of Computational Biology. 25(8):862-870. https://doi.org/10.1089/cmb.2018.0087

Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: http://hdl.handle.net/10251/149916

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Título: FaST-LMM for two-way Epistasis tests on high performance clusters
Autor: Martínez, Héctor Barrachina, Sergio Castillo, Maribel Quintana Ortí, Enrique Salvador Rambla de Argila, Jordi Farre, Xavier Navarro, Arcadi
Entidad UPV: Universitat Politècnica de València. Departamento de Informática de Sistemas y Computadores - Departament d'Informàtica de Sistemes i Computadors
Fecha difusión:
Resumen:
[EN] We introduce a version of the epistasis test in FaST-LMM for clusters of multithreaded processors. This new software maintains the sensitivity of the original FaST-LMM while delivering acceleration that is close to ...[+]
Palabras clave: Clusters of computers , Epistasis , FaST-LMM , Genome-wide association studies (GWAS) , GPUs , Multicore processors
Derechos de uso: Reserva de todos los derechos
Fuente:
Journal of Computational Biology. (issn: 1066-5277 )
DOI: 10.1089/cmb.2018.0087
Editorial:
Mary Ann Liebert
Versión del editor: https://doi.org/10.1089/cmb.2018.0087
Código del Proyecto:
info:eu-repo/grantAgreement/WT/Genetics, Genomics and Population Research/076113/The genetics of weight, BMI, adiposity and obesity/
info:eu-repo/grantAgreement/MINECO//TIN2014-53495-R/ES/COMPUTACION HETEROGENEA DE BAJO CONSUMO/
info:eu-repo/grantAgreement/AEI/Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2013-2016/TIN2017-82972-R/ES/TECNICAS ALGORITMICAS PARA COMPUTACION DE ALTO RENDIMIENTO CONSCIENTE DEL CONSUMO ENERGETICO Y RESISTENTE A ERRORES/
Agradecimientos:
The researchers from the Universitat Jaume I were supported by projects TIN2014-53495-R and TIN2017-82972-R of the MINECO and FEDER.
Tipo: Artículo

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