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On Compensation Loops in Genomic Duplications

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dc.contributor.author Sempere Luna, José María es_ES
dc.date.accessioned 2021-02-16T04:32:22Z
dc.date.available 2021-02-16T04:32:22Z
dc.date.issued 2020-01 es_ES
dc.identifier.issn 0129-0541 es_ES
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10251/161386
dc.description Electronic version of an article published as International Journal of Foundations of Computer Science 2020 31:01, 133-142, DOI: 10.1142/S0129054120400092 © World Scientific Publishing Company https://www.worldscientific.com/worldscinet/ijfcs es_ES
dc.description.abstract [EN] In this paper, we investigate the compensation loops, a DNA rearrangement in chromosomes due to unequal crossing over. We study the e fect of compensation loops over the gene duplication, and we formalize it as a restricted case of gene duplication in general. We study this biological process under the point of view of formal languages, and we provide some results about the languages de fined in this way. es_ES
dc.language Inglés es_ES
dc.publisher World Scientific es_ES
dc.relation.ispartof International Journal of Foundations of Computer Science es_ES
dc.rights Reserva de todos los derechos es_ES
dc.subject DNA rearrangement es_ES
dc.subject Duplication over strings es_ES
dc.subject Formal languages es_ES
dc.subject Regular expressions es_ES
dc.subject.classification LENGUAJES Y SISTEMAS INFORMATICOS es_ES
dc.title On Compensation Loops in Genomic Duplications es_ES
dc.type Artículo es_ES
dc.identifier.doi 10.1142/S0129054120400092 es_ES
dc.rights.accessRights Abierto es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Departamento de Sistemas Informáticos y Computación - Departament de Sistemes Informàtics i Computació es_ES
dc.description.bibliographicCitation Sempere Luna, JM. (2020). On Compensation Loops in Genomic Duplications. International Journal of Foundations of Computer Science. 31(1):133-142. https://doi.org/10.1142/S0129054120400092 es_ES
dc.description.accrualMethod S es_ES
dc.relation.publisherversion https://doi.org/10.1142/S0129054120400092 es_ES
dc.description.upvformatpinicio 133 es_ES
dc.description.upvformatpfin 142 es_ES
dc.type.version info:eu-repo/semantics/publishedVersion es_ES
dc.description.volume 31 es_ES
dc.description.issue 1 es_ES
dc.relation.pasarela S\402031 es_ES
dc.description.references Bovet, D. P., & Varricchio, S. (1992). On the regularity of languages on a binary alphabet generated by copying systems. Information Processing Letters, 44(3), 119-123. doi:10.1016/0020-0190(92)90050-6 es_ES
dc.description.references Dassow, J., Mitrana, V., & Salomaa, A. (1997). Context-free evolutionary grammars and the structural language of nucleic acids. Biosystems, 43(3), 169-177. doi:10.1016/s0303-2647(97)00036-1 es_ES
dc.description.references Ehrenfeucht, A., & Rozenberg, G. (1984). On regularity of languages generated by copying systems. Discrete Applied Mathematics, 8(3), 313-317. doi:10.1016/0166-218x(84)90129-x es_ES
dc.description.references Leupold, P., Martín-Vide, C., & Mitrana, V. (2005). Uniformly bounded duplication languages. Discrete Applied Mathematics, 146(3), 301-310. doi:10.1016/j.dam.2004.10.003 es_ES
dc.description.references Leupold, P., & Mitrana, V. (2007). Uniformly bounded duplication codes. RAIRO - Theoretical Informatics and Applications, 41(4), 411-424. doi:10.1051/ita:2007021 es_ES
dc.description.references Leupold, P., Mitrana, V., & Sempere, J. M. (2003). Formal Languages Arising from Gene Repeated Duplication. Lecture Notes in Computer Science, 297-308. doi:10.1007/978-3-540-24635-0_22 es_ES
dc.description.references Rozenberg, G., & Salomaa, A. (Eds.). (1997). Handbook of Formal Languages. doi:10.1007/978-3-642-59126-6 es_ES


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