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Use of Defective DNA (DI) from Beet curly top virus as gene delivery vector

RiuNet: Repositorio Institucional de la Universidad Politécnica de Valencia

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Use of Defective DNA (DI) from Beet curly top virus as gene delivery vector

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dc.contributor.advisor Armengol Fortí, Josep es_ES
dc.contributor.advisor Weigand, Susanne es_ES
dc.contributor.author Ilyas, Rabia es_ES
dc.date.accessioned 2021-06-30T08:09:47Z
dc.date.available 2021-06-30T08:09:47Z
dc.date.created 2019-10-24
dc.date.issued 2021-06-30 es_ES
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10251/168548
dc.description.abstract [ES] En este estudio, se obtuvo un ADN defectivo (DI) dominante de 1 kb de remolacha azucarera infectada (SB), utilizando un sistema de amplificación de círculo rodante. Este DI contenía la región conservada, así como algunas partes de los genes C1 y C4 del virus Beet curly top virus (BCTV). El siguiente paso después del aislamiento de un DI fue hacer un clon infeccioso, que es importante para caracterizar y manipular un virus a nivel molecular y biológico. El clon infeccioso permite la manipulación del genoma viral a voluntad, lo que permite un análisis genético sin precedentes y el uso de virus como vectores para varios propósitos. Puede administrarse a plantas / células hospedadoras utilizando un sistema Agrobacterium. Este es el primer estudio de obtención de DI de plantas infectadas a corto plazo (5-6 dpi) y DI de BCTV que se replica en Agrobacterium. Todos los estudios anteriores han obtenido DI de plantas infectadas a largo plazo y lo han utilizado solo para producir transgénicos, este estudio representa el primer esfuerzo para explorar su replicación y estabilidad. Debido a la limitación de tiempo, no se pudieron realizar más experimentos para analizar la capacidad de carga de DI como vector de entrega de genes. En el futuro, se pueden clonar genes estándar de diferentes tamaños en el MCS y los clones exitosos se pueden probar para determinar la expresión génica en plantas usando infiltración de agrobacterias. es_ES
dc.description.abstract [EN] In this study, a dominant 1kb defective DNA (DI) was obtained from the infected sugar beet (SB) using rolling circle amplification system. This DI contained the conserved region as well as some parts of C1 and C4 genes of Beet curly top virus (BCTV). The next step after isolation of a DI was to make an infectious clone, which is important to characterize and manipulate a virus at the molecular and biological levels. The infectious clone enables manipulation of the viral genome at will, allowing unprecedented genetic analysis and the use of viruses as vectors for several purposes. It can be delivered into host plants/cells using an Agrobacterium system. This is the first report of obtaining DI from short-term infected plants (5-6 dpi) and DI from BCTV replicating in agrobacterium. All the previous studies have obtained DI from long-term infected plants and used it only to produce transgenics, this study is the first effort to explore its replication and stability. Due to time limitation, further experiments could not be performed to analyze the cargo capacity of DI as a gene delivery vector. In future, standard genes of different sizes can be cloned in the MCS and the successful clones can be tested for gene expression in plants using agrobacterium infiltration. es_ES
dc.description.sponsorship This research has been developed as a result of a mobility stay funded by the Erasmus+ - KA1 Erasmus Mundus Joint Master's Degree Programme of the European Commission under the PLANT HEALTH Project
dc.format.extent 37 es_ES
dc.language Inglés es_ES
dc.publisher Universitat Politècnica de València es_ES
dc.rights Reserva de todos los derechos es_ES
dc.subject Geminivirus es_ES
dc.subject Fitopatología es_ES
dc.subject Remolacha azucarera es_ES
dc.subject Virología es_ES
dc.subject Plant viruses es_ES
dc.subject Sugar Beet es_ES
dc.subject Phytopathology es_ES
dc.subject Virology es_ES
dc.subject Geminiviridae es_ES
dc.subject.classification PRODUCCION VEGETAL es_ES
dc.subject.other Máster Universitario Erasmus Mundus en Sanidad Vegetal en Agricultura Sostenible/ European Master degree in Plant Health in Sustainable Cropping Systems-Màster Universitari Erasmus Mundus en Sanitat Vegetal en Agricultura Sostenible / European Master's Degree in Plant Health in Sustainable Cropping Systems es_ES
dc.title Use of Defective DNA (DI) from Beet curly top virus as gene delivery vector es_ES
dc.title.alternative Uso de ADN defectuoso (DI) del virus Beet curly top como vector de entrega de genes
dc.type Tesis de máster es_ES
dc.rights.accessRights Cerrado es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Departamento de Ecosistemas Agroforestales - Departament d'Ecosistemes Agroforestals es_ES
dc.description.bibliographicCitation Ilyas, R. (2019). Use of Defective DNA (DI) from Beet curly top virus as gene delivery vector. Universitat Politècnica de València. http://hdl.handle.net/10251/168548 es_ES
dc.description.accrualMethod TFGM es_ES
dc.relation.pasarela TFGM\144509 es_ES


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