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Evolutionary analysis of tomato Sw-5 resistance breaking isolates of Tomato spotted wilt virus

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Evolutionary analysis of tomato Sw-5 resistance breaking isolates of Tomato spotted wilt virus

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Nombre: 2011-JGV-López.pdf
Tamaño: 188.3Kb
Formato: PDF
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dc.contributor.author López Del Rincón, Carmelo es_ES
dc.contributor.author Aramburu, J. es_ES
dc.contributor.author Galipienso, L. es_ES
dc.contributor.author Soler Aleixandre, Salvador es_ES
dc.contributor.author Nuez Viñals, Fernando es_ES
dc.contributor.author Rubio, L. es_ES
dc.date.accessioned 2013-05-08T11:58:13Z
dc.date.issued 2011-01
dc.identifier.issn 0022-1317
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10251/28685
dc.description.abstract [EN] Tomato spotted wilt virus (TSWV) causes severe economic losses in many crops worldwide and often overcomes resistant cultivars used for disease control. Comparison of nucleotide and amino acid sequences suggested that tomato resistance conferred by the gene Sw-5 can be overcome by the amino acid substitution C to Y at position 118 (C118Y) or T120N in the TSWV movement protein, NSm. Phylogenetic analysis revealed that substitution C118Y has occurred independently three times in the studied isolates by convergent evolution, whereas the substitution T120N was a unique event. Analysis of rates of non-synonymous and synonymous changes at individual codons showed that substitution C118Y was positively selected. © 2011 SGM. es_ES
dc.description.sponsorship This work was supported by the INIA (grants RTA04-004-C2 and RTA2008-00010-C03), the MEC (AGL2005-07754) and the Generalitat Valenciana (ACOMP/07/225 and ACOMP/2009/103). We would like to thank A. Barba for technical assistance and Professors Santiago F. Elena, Pedro Moreno and Bryce W. Falk for their excellent review of the manuscript and Daniel R. Pearce for English editing. en_EN
dc.language Inglés es_ES
dc.publisher Society for General Microbiology es_ES
dc.relation.ispartof Journal of General Virology es_ES
dc.rights Reserva de todos los derechos es_ES
dc.subject Amino acid sequence es_ES
dc.subject Amino acid substitution es_ES
dc.subject Article es_ES
dc.subject Codon es_ES
dc.subject Convergent evolution es_ES
dc.subject Cultivar es_ES
dc.subject Disease control es_ES
dc.subject Gene es_ES
dc.subject Nonhuman es_ES
dc.subject Nucleotide sequence es_ES
dc.subject Phylogeny es_ES
dc.subject Priority journal es_ES
dc.subject Sw 5 gene es_ES
dc.subject Tomato es_ES
dc.subject Tospovirus es_ES
dc.subject DNA Mutational Analysis es_ES
dc.subject Lycopersicon esculentum es_ES
dc.subject Molecular Sequence Data es_ES
dc.subject Mutation, Missense es_ES
dc.subject Plant Proteins es_ES
dc.subject Plant Viral Movement Proteins es_ES
dc.subject RNA, Viral es_ES
dc.subject Sequence Analysis, DNA es_ES
dc.subject Tomato spotted wilt virus es_ES
dc.subject.classification GENETICA es_ES
dc.subject.classification MICROBIOLOGIA es_ES
dc.title Evolutionary analysis of tomato Sw-5 resistance breaking isolates of Tomato spotted wilt virus es_ES
dc.type Artículo es_ES
dc.embargo.lift 10000-01-01
dc.embargo.terms forever es_ES
dc.identifier.doi 10.1099/vir.0.026708-0
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/MICINN//RTA04-004-C2/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/MICINN//RTA2008-00010-C03-01/ES/Diversidad genética y factores evolutivos y epidemiológicos implicados en los aislados españoles de TSWV que superan las resistencias genéticas Sw-5 de tomate y Tsw de pimiento/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/MICINN//RTA2008-00010-C03-03/ES/Estudio de los determinantes genéticos de TSWV implicados en la superación de las resistencias de tomate y pimiento. Desarrollo de nuevas variedades resistentes/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/MICINN//RTA2008-00010-C03-02/ES/Caracterización de aislados del virus del bronceado (TSWV) que sobrepasan la resistencia del gen Tsw en pimiento. Puesta a punto de la utilización de RNA de interferencia como método de control/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/MEC//AGL2005-07754/ES/ESTUDIO DEL EFECTO DE LAS INFECCIONES MIXTAS Y LA TRANSMISION POR INSECTOS EN LA POBLACION DE VIRUS VEGETALES/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/GVA//ACOMP%2F07%2F225/
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/Generalitat Valenciana//ACOMP%2F2009%2F103/ES/Diversidad genética y factores evolutivos y epidemiológicos implicados en los aislados españoles de TSWV que superan las resistencias genéticas Sw-5 de tomate y Tsw de pimiento/
dc.rights.accessRights Cerrado es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Departamento de Biotecnología - Departament de Biotecnologia es_ES
dc.description.bibliographicCitation López Del Rincón, C.; Aramburu, J.; Galipienso, L.; Soler Aleixandre, S.; Nuez Viñals, F.; Rubio, L. (2011). Evolutionary analysis of tomato Sw-5 resistance breaking isolates of Tomato spotted wilt virus. Journal of General Virology. 92:210-215. https://doi.org/10.1099/vir.0.026708-0 es_ES
dc.description.accrualMethod S es_ES
dc.relation.publisherversion http://doi.org/10.1099/vir.0.026708-0 es_ES
dc.description.upvformatpinicio 210 es_ES
dc.description.upvformatpfin 215 es_ES
dc.type.version info:eu-repo/semantics/publishedVersion es_ES
dc.description.volume 92 es_ES
dc.relation.senia 39488
dc.identifier.pmid 20881087
dc.contributor.funder Ministerio de Educación y Ciencia
dc.contributor.funder Generalitat Valenciana
dc.contributor.funder Ministerio de Ciencia e Innovación es_ES


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