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Adaptive step ODE algorithms for the 3D simulation of electric heart activity with graphics processing units

RiuNet: Repositorio Institucional de la Universidad Politécnica de Valencia

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Adaptive step ODE algorithms for the 3D simulation of electric heart activity with graphics processing units

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dc.contributor.author García Mollá, Víctor Manuel es_ES
dc.contributor.author Liberos Mascarell, Alejandro es_ES
dc.contributor.author Vidal Maciá, Antonio Manuel es_ES
dc.contributor.author Guillem Sánchez, María Salud es_ES
dc.contributor.author Millet Roig, José es_ES
dc.contributor.author González Salvador, Alberto es_ES
dc.contributor.author Martínez Zaldívar, Francisco José es_ES
dc.contributor.author Climent, Andreu M. es_ES
dc.date.accessioned 2014-09-23T10:41:10Z
dc.date.available 2014-09-23T10:41:10Z
dc.date.issued 2014-02
dc.identifier.issn 0010-4825
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10251/39864
dc.description.abstract In this paper we studied the implementation and performance of adaptive step methods for large systems of ordinary differential equations systems in graphics processing units, focusing on the simulation of three-dimensional electric cardiac activity. The Rush-Larsen method was applied in all the implemented solvers to improve efficiency. We compared the adaptive methods with the fixed step methods, and we found that the fixed step methods can be faster while the adaptive step methods are better in terms of accuracy and robustness. (c) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved. es_ES
dc.description.sponsorship This work has been partially funded by Universitat Politecnica de Valencia through Programa de Apoyo a la InvestigaciOn y Desarrollo (PAID-06-11) and (PAID-05-12), by Generalitat Valenciana through projects PROMETEO/2009/013 and Ayudas para la realizacion de proyectos de I+D para grupos de investigacion emergentes GV/2012/039, and by Ministerio Espafiol de Economia y Competitividad through project TEC2012-38142-004. en_EN
dc.language Inglés es_ES
dc.publisher Elsevier es_ES
dc.relation.ispartof Computers in Biology and Medicine es_ES
dc.rights Reserva de todos los derechos es_ES
dc.subject Adaptive ODE solvers es_ES
dc.subject Embedded Runge-Kutta methods es_ES
dc.subject GPU computing es_ES
dc.subject Cardiac electrophysiology es_ES
dc.subject Rush-Larsen method es_ES
dc.subject.classification CIENCIAS DE LA COMPUTACION E INTELIGENCIA ARTIFICIAL es_ES
dc.subject.classification INGENIERIA TELEMATICA es_ES
dc.subject.classification TECNOLOGIA ELECTRONICA es_ES
dc.subject.classification TEORIA DE LA SEÑAL Y COMUNICACIONES es_ES
dc.title Adaptive step ODE algorithms for the 3D simulation of electric heart activity with graphics processing units es_ES
dc.type Artículo es_ES
dc.identifier.doi 10.1016/j.compbiomed.2013.10.023
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/UPV//PAID-05-12/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/UPV//PAID-06-11/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/Generalitat Valenciana//PROMETEO09%2F2009%2F013/ES/Computacion de altas prestaciones sobre arquitecturas actuales en porblemas de procesado múltiple de señal/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/GVA//GV%2F2012%2F039/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/MINECO//TEC2012-38142-C04-01/ES/PROCESADO DISTRIBUIDO Y COLABORATIVO DE SEÑALES SONORAS: CONTROL ACTIVO/ es_ES
dc.rights.accessRights Abierto es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Departamento de Sistemas Informáticos y Computación - Departament de Sistemes Informàtics i Computació es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Departamento de Ingeniería Electrónica - Departament d'Enginyeria Electrònica es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Departamento de Comunicaciones - Departament de Comunicacions es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Instituto Universitario de Aplicaciones de las Tecnologías de la Información - Institut Universitari d'Aplicacions de les Tecnologies de la Informació es_ES
dc.description.bibliographicCitation García Mollá, VM.; Liberos Mascarell, A.; Vidal Maciá, AM.; Guillem Sánchez, MS.; Millet Roig, J.; González Salvador, A.; Martínez Zaldívar, FJ.... (2014). Adaptive step ODE algorithms for the 3D simulation of electric heart activity with graphics processing units. Computers in Biology and Medicine. 44:15-26. https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2013.10.023 es_ES
dc.description.accrualMethod S es_ES
dc.relation.publisherversion http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiomed.2013.10.023 es_ES
dc.description.upvformatpinicio 15 es_ES
dc.description.upvformatpfin 26 es_ES
dc.type.version info:eu-repo/semantics/publishedVersion es_ES
dc.description.volume 44 es_ES
dc.relation.senia 253368
dc.contributor.funder Generalitat Valenciana es_ES
dc.contributor.funder Universitat Politècnica de València es_ES
dc.contributor.funder Ministerio de Economía y Competitividad es_ES


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