Obtención de marcadores moleculares para la identificación inequívoca de nuevas variedades de cítricos

Abstract

[EN] The unambiguous identification of protected citrus´s varieties is necessary to exercise the plant breeders' rights. Therefore, the present work use the current genomic tools developed by Citruseq/Citrusgenn consortium to obtain molecular markers in order to identify the Clemenverd, Neufina and Nero varieties regarding Arrufatina, Clemenpons, Clementard, Clementina Fina, Clemenules, Hernandina, Marisol, Nour and Oroval varieties. For this purpose, the sequence of these 12 varieties were analyzed to detect "in silico" chromosomal rearrangements, INDELs and SNPs exclusive for each variety. Subsequently, the validation of seven molecular markers that allow the identification of Clemenverd, Neufina and Nero varieties were achieved using the real time PCR and Sanger fluorophores sequencing of the amplified fragments.

[ES] La identificación inequívoca de variedades de cítricos protegidas es esencial para ejercer los derechos propios del obtentor. Por ello, este trabajo consistirá en la utilización de las actuales herramientas genómicas desarrolladas por el consorcio Citruseq/Citrusgenn para la obtención de marcadores moleculares que permitan la identificación de las variedades Clemenverd, Neufina y Nero respecto a las variedades Arrufatina, Clemenpons, Clementard, Clementina Fina, Clemenules, Hernandina, Marisol, Nour y Oroval. Para ello se han analizado las secuencia de estas 12 variedades para la detección “in silicio” de reordenamientos cromosómicos, INDELs y SNPs exclusivos para cada variedad. Posteriormente se han validado un total de siete marcadores moleculares que permiten la identificación de las variedades Clemenverd, Neufina y Nero utilizando la PCR en tiempo real y la secuenciación Sanger por fluoróforos de los fragmentos amplificados.