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Fast inexact mapping using advanced tree exploration on backward search methods

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Fast inexact mapping using advanced tree exploration on backward search methods

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Salavert Torres, J.; Tomás Domínguez, AE.; Tárraga Giménez, J.; Medina Castelló, I.; Dopazo Blazquez, J.; Blanquer Espert, I. (2015). Fast inexact mapping using advanced tree exploration on backward search methods. BMC Bioinformatics. 16(18):1-11. doi:10.1186/s12859-014-0438-3.

Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: http://hdl.handle.net/10251/52360

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Metadatos del ítem

Título: Fast inexact mapping using advanced tree exploration on backward search methods
Autor:
Entidad UPV: Universitat Politècnica de València. Instituto de Instrumentación para Imagen Molecular - Institut d'Instrumentació per a Imatge Molecular
Universitat Politècnica de València. Departamento de Sistemas Informáticos y Computación - Departament de Sistemes Informàtics i Computació
Fecha difusión:
Resumen:
Background: Short sequence mapping methods for Next Generation Sequencing consist on a combination of seeding techniques followed by local alignment based on dynamic programming approaches. Most seeding algorithms are ...[+]
Palabras clave: Sequence mapping , Burrows-wheeler , FM-Index , Suffix array
Derechos de uso: Reconocimiento (by)
Fuente:
BMC Bioinformatics. (issn: 1471-2105 )
DOI: 10.1186/s12859-014-0438-3
Editorial:
BioMed Central
Versión del editor: http://dx.doi.org/10.1186/s12859-014-0438-3
Patrocinador:
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Tipo: Artículo

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