Estudio metatranscriptómico del desarrollo de la microbiota intestinal en infantes

Abstract

[ES] El intestino humano es el hábitat natural de una comunidad bacteriana dinámica y diversa que tiene una gran importancia para la salud humana. La colonización del tracto gastrointestinal en infantes es compleja y con una gran variabilidad interindividual. Para comprender como se desarrolla la funcionalidad de la microbiota intestinal es importante comprender tanto su composición como la expresión génica de sus miembros. En este trabajo se va a proceder al análisis del metatranscriptoma, es decir del RNA total producido por la microbiota intestinal, en una cohorte de infantes de la cual se han obtenido muestras fecales a lo largo del primer año de vida. El RNA se purificará, retrotranscribirá y secuenciará mediante la tecnología Illumina, y las secuencias obtenidas se analizarán mediante técnicas bioinformáticas y estadísticas para comprender como evoluciona la expresión génica de la microbiota intestinal durante este periodo.

[EN] The human gut constitutes the natural habitat of a dynamic and diverse bacterial community, which acquires a great importance for human health. The gastrointestinal track colonization in infants is complex and comprises a great interindividual variability. In order to understand how the gut´s microbiota functionality develops, it is important to comprehend not only its composition but also the gene expression of its members. In the present work, the metatranscriptome, that is the total RNA produced by the intestinal microbiota, was analysed in a cohort of infants, from which stool samples were collected along the first year of life. Total RNA was purified and ribosomal RNAs were eliminated. The remaining RNAs were retrotranscribed and sequenced by means of Illumina technology and the recovered sequences were bioinformatically processed, filtered and analysed to obtain a dataset corresponding to bacterial messenger RNAs. These sequences are ready for further bioinformatics and statistical analysis aimed at addressing how the intestinal microbiota evolves during this period.