Análisis de aislados europeos del virus del grapevine leafroll-associated virus-1 (GLRaV-1) en vid

Abstract

[EN] Grapevine (Vitis vinifera L.) is one of the most cultivated perennial fruit crops around the world devoted primarily to the viticulture industry. Grapevine Leafroll-associated Virus-1 (GLRaV-1) is one of the most important agents of the grapevine leafroll disease, so it is important to permit the proper sanitation control of vines. In addition, testing for GLRaV-1 virus in grapevines is important in the mandatory certification programs within the European Union. Therefore, obtaining a fast, accurate and reliable diagnostic assay is necessary. Currently, no combination of primers has been described allowing detection of all virus isolates by RT-PCR. In addition, information about the genetic variability of the virus is scarce. In order to improve and validate the molecular detection techniques by RT – PCR, different European isolates have been amplified using different pairs of primers previously described in the literature, as well as some designed in this Master thesis. Since no amplification was obtained from all isolates with any combination of primers, the variability of three regions of the GLRaV-1 genome was analyzed (CP, CPm2 and p24). Knowledge of the virus´s variability is important for developing reliable diagnostic strategies to help manage the leafroll disease.

[ES] La vid (Vitis vinifera L.) es uno de los cultivos frutales perennes más cultivados en todo el mundo, dedicado principalmente a la industria vitivinícola. El virus Grapevine Leafroll-associated Virus-1 (GLRaV-1) es uno de los agentes causales más importantes de la enfermedad del enrollado de la hoja, por lo que es importante realizar un control adecuado del estado sanitario de las viñas. Además, la detección del virus GLRaV-1 en el cultivo de la vid es obligatoria en los programas de certificación dentro de la Unión Europea. Por ello, es necesario disponer de un método de diagnóstico rápido, preciso y fiable. Actualmente, no se ha descrito ninguna combinación de primers que permita la detección mediante técnicas moleculares de todos los aislados del virus. Además, se dispone de escasa información de la variabilidad genética del virus. Con el objetivo de mejorar y validar las técnicas de detección molecular mediante RT – PCR se han amplificado distintos aislados europeos con diversas combinaciones de primers previamente descritos en bibliografía, así como algunos diseñados en el presente trabajo. Dado que no se ha obtenido la amplificación de todos los aislados con ninguna combinación de primers se ha analizado la variabilidad del virus GLRaV-1 en tres regiones de su genoma (CP, CPm2 y p24). El conocimiento de la variabilidad del virus será utilizado para el desarrollo de estrategias de diagnóstico fiables que permitan controlar la enfermedad del enrollado 1.