Manejo de una colección preliminar de líneas de introgresión de Solanum peruvianum en el fondo genético del tomate cultivado

Abstract

[ES] Las poblaciones de premejora constituyen una herramienta muy útil en la mejora de los cultivos. Se han desarrollado poblaciones de premejora a partir de distintas especies silvestres relacionadas con el tomate (Solanum lycopersium L.). En el caso de la especie Solanum peruvianum los materiales más avanzados desarrollados hasta el momento por otros autores consisten en poblaciones BC3. La entrada PI 126944 de esta especie resulta de interés por presentar resistencia distintas plagas y enfermedades. En el ¿Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana¿ (COMAV) se dispone de generaciones avanzadas desarrolladas a partir de un cruce inicial entre la entrada PI 126944 y el tomate cultivado. En concreto, los materiales más avanzados constituyen el tercer retrocruce hacia tomate de generaciones pseudo-F5 desarrolladas a partir del cruce interespecífico inicial. Por otra parte, se han identificado marcadores moleculares polimórficos tipo CAPS (cleaved amplified polymorphic DNA) entre los parentales de estas generaciones. El objetivo de este trabajo es el avance en el desarrollo de la colección de líneas de introgresión (introgression lines, ILs) de S. peruvianum PI 126944 en el fondo genético del tomate cultivado. Para ello, por una parte, se pretende obtener semilla de autofecundación de los materiales disponibles. Por otra parte, se avanzará en el genotipado de las generaciones disponibles hasta el momento. El trabajo se realizará empleando un conjunto de plantas de generaciones avanzadas derivadas de PI 126944. Los materiales mantenidos in vitro se aclimatarán y se trasplantarán a invernadero, con objeto de comprobar si las plantas florecen, cuajan frutos de autofecundación y si estos frutos tienen semillas viables. Para el genotipado, a partir del tejido vegetal de hoja joven se realizará la extracción del ADN por el método del CTAB. Inicialmente, el genotipado se llevará a cabo mediante marcadores moleculares tipo CAPS. Tras al amplificación mediante PCR, los resultados se visualizarán en gel horizontal de agarosa, mediante tinción con bromuro de etidio. Alternativamente, se está realizando un análisis de genotipado por secuenciación (genotyping by sequencing, GBS) con objeto de identificar marcadores SNPs (single nucleotide polymorphism) entre los parentales de la colección de ILs. Si en el curso del TFG están disponibles los resultados de este análisis GBS, se emplearán los datos resultantes para desarrollar nuevos marcadores útiles en el genotipado de estos materiales.

[EN] Prebred populations are a useful tool in breeding. Prebred populations have been developed derived from different wild tomato (Solanum lycopersium L.) relatives. BC3 populations are the most advanced available in the case of the wild relative S. peruvianum. The interest of accession S. peruvianum PI 126944 lies on its resistance to different pests and diseases. Advanced generations derived from an initial cross between PI 126944 and cultivated tomato are available at the ¿Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana¿ (COMAV). Concretely, the most advanced plant materials correspond to the third backcross to tomato of pseudo-F5 generations derived from the initial interspecific cross. On the other hand, CAPS (cleaved amplified polymorphic DNA) markers polymorphic between the parents of these generations have been identified. The objective of this work is the advance in the development of the set of introgression lines (ILs) of S. peruvianum PI 126944 in the tomato genetic background. With this aim, on one hand, seeds from selfing of the plant materials available will be obtained. On the other hand, new data will be produced regarding the genotype of the generations available. The work will be carried out with a set of pants belonging to advanced generations derived from PI 126944. Plant materials conserved in vitro will be acclimatized and transferred to a greenhouse, to check if they bloom, set fruits from selfing and if these fruits have viable seeds. To continue with the genotyping, DNA isolation will be carried out from young leaves tissue, using the CTAB method. Initially, the genotyping will be done with CAPS markers. After PCR amplification, results will be visualized by agarose gel and ethidium bromide staining. Alternatively, a genotyping by sequencing (GBS) analysis is in progress, with the objective of identifying SNP markers (single nucleotide polymorphism) between the initial parents of the ILs. Provided the results from this GBS analysis are available in the course of this TFG, the data will be used in the development of new markers useful in the genotyping of these plant materials.