Predicción de estructuras bioquímicas mediante autómatas finitos biomoleculares

Abstract

[ES] La predicción de estructuras secundarias a partir de una cadena de ARN resulta muy importante para, por ejemplo, poder detectar mutaciones que pueden afectar a los organismos vivos. En este trabajo se ha desarrollado una herramienta que mediante un autómata de WatsonCrick modelado, es capaz de predecir la presencia de algunas de estas estructuras como un tipo de pseudonudo, horquillas y dobles horquillas dada una cadena en formato FASTA de ARN.

[EN] The secondary structure prediction from RNA chain is very important, for example, to detect mutations that can affect alive organisms. In this paper has been developed a tool by a WatsonCrick modeling automata, is able to predict the presence of some of these structures as a kind of pseudoknot, hairpins and double hairpins given a chain RNA in FASTA format.