Presencia del virus meridional del tomate (Southern tomato virus, STV) en variedades de tomate locales e híbridos y su implicación en la ruptura de la protección cruzada frente a PepMV

Abstract

El virus meridional del tomate (Southern tomato virus, STV) es un virus de RNA de doble cadena, perteneciente al género Amalgavirus, familia Amalgaviridae. Fue descubierto en 2009 en los Estados Unidos (California y Missisipi) y en el sudeste de México en plantas de tomate que presentaban síntomas de atrofia, decoloración y reducción del tamaño del fruto. Posteriormente se detectó en plantaciones con síntomas similares en España, Italia, Francia, China y Bangladesh, y en Florida y Korea en plantas asintomáticas. Se transmite de forma vertical a través de semilla pudiendo superar el 70%. Actualmente no se conoce el papel que desempeña STV en el desarrollo de síntomas de tomate descritos, ya que generalmente se encuentra en coinfección con otros virus como el virus del mosaico del pepino (PepMV), o el virus del mosaico del tomate (ToMV), o en plantas que no presentan síntoma alguno. Está presente en la mayoría de las variedades comerciales de tomate híbridas.

Los objetivos del presente trabajo son establecer la presencia de STV en diferentes variedades de tomate locales de España, determinar qué parental es el transmisor de STV en un programa de mejora genética de tomate y evaluar el efecto de la presencia de STV en la protección cruzada de PepMV frente a un aislado agresivo de PepMV.

El trabajo se desarrollará en el Laboratorio de Virología del Instituto Agroforestal Mediterráneo a través de ensayos en condiciones de laboratorio y análisis de muestras mediante las técnicas moleculares: RT PCR (transcripción reversa de la reacción en cadena de la polimerasa) y Real-time LAMP (Loop Mediated Amplification) con cebadores específicos de los virus a evaluar.

Valencià: El virus meridional de la tomaca (Southern tomato virus, STV) és un virus de RNA de doble cadena, pertanyent al gènere Amalgavirus, família Amalgaviridae. Va ser descobert en 2009 als Estats Units (Califòrnia i Missisipi) i en el sud-est de Mèxic en plantes de tomaca que presentaven símptomes d'atròfia, decoloració i reducció de la grandària del fruit. Posteriorment es va detectar en plantacions amb símptomes semblants a Espanya, Itàlia, França, Xina i Bangla desh, i a Florida i Korea en plantes asimptomàtiques. Es transmet de forma vertical a través de llavor podent superar el 70%. Actualment no es coneix el paper que exercix STV en el desenrotllament de símptomes de tomaca descrits, ja que generalment es troba en coinfección amb altres virus com el virus del mosaic del cogombre (PepMV), o el virus del mosaic de la tomaca (ToMV), o en plantes que no presenten cap símptoma. Està present en la majoria de les varietats comercials de tomaca híbrida. Els objectius del present treball són establir la presència de STV en diferents varietats de tomaca locals d'Espanya, determinar què parental és el transmissor de STV en un programa de millora genètica de tomaca i avaluar l'efecte de la presència de STV en la protecció encreuada de PepMV enfront d'un aïllat agressiu de PepMV. El treball es desenrotllarà en el Laboratori de Virologia de l'Institut Agroforestal Mediterrani a través d'assajos en condicions de laboratori i anàlisi de mostres per mitjà de les tècniques moleculars: RT-PCR (transcripció reversa de la reacció en cadena de la polimerasa) i Real-time LAMP (Loop Mediated Amplification) amb carabassetes específiques dels virus a avaluar"

Southern tomato virus (STV) is a double-stranded RNA virus that belongs to the Amalgavirus genus in Amalgaviridae family. It was discovered in 2009 in the United States of America (California and Mississippi) and the southeast of Mexico on tomato plants that showed stunting, discoloration and fruit size reduction. Lately, it was detected on plantations with similar symptoms in Spain, Italy, France, China and Bangladesh. Asymptomatic plants infected with STV were also discovered in Florida and Korea. The virus is transmitted vertically through seeds with a transmission rate over 70%. STV is generally present in co-infection with other tomato viruses such as Cucumber mosaic virus (CMV) or Tomato mosaic virus (ToMV). Therefore it is not clear which symptoms described on tomatoes are originated by STV infection. Even though STV is present in most of the hybrid commercial varieties. The objectives of the present study were to establish the presence of STV on different local Spanish tomato varieties, to determine the parental source of STV in a breeding program and to evaluate the effect of STV in a cross-protected tomatoes against an aggressive PepMV isolate. The study would be held at the Virology Laboratory of the Instituto Agroforestal Mediterráneo through different assyas performed under controlled conditions and the sample would be analysed with molecular techniques such as RT-PCR and Real-time LAMP with the use of specific primers.