Análisis de expresión génica en manchas rojas en la piel de la trucha marrón (Salmo trutta)

Abstract

[EN] Recently, using electron microscopy, two types of erythrophores were described in the skin of brown trout (Salmo trutta): type 1, present in black spot skin sections; and a novel type 2 with a unique ultrastructure, located only in red spot skin sections (Djurdjevič et al., 2015). Additionally, transcriptome analysis of differently pigmented skin regions of trout was performed in order to detect genes that influence the skin pigment pattern in trout (Djurdjevič et al., 2019). The aim of the current study is to analyse the expression of genes in differently pigmented brown trout skin, especially to identify genes almost exclusively expressed in the red spot of brown trout skin, and by that define the expression profile of the novel type of pigment cell, erythrophore type 2. Expression of candidate genes identified from transcriptome analysis was done on more biological samples of brown trout and on differently pigmented skin regions using qPCR analysis. Expression profile of differently pigmented skin regions was compared and genes with differential expression pattern in red spot were identified and their potential role in erythrophore type 2 and red spot maintenance in brown trout skin discussed.

[ES] Recientemente, con el uso de la microscopía electrónica se han descubierto dos tipos de eritróforos en la piel de la trucha marrón (Salmo trutta). Un primer tipo, presente en secciones de piel con manchas negras, y un segundo tipo innovador con una estructura única, localizado solo en secciones de piel con manchas rojas (Djurdjevič et al., 2015). Además, se han realizado análisis transcriptómicos de regiones de piel de trucha con diferente pigmentación para detectar los genes que influyen en tal patrón de pigmentación (Djurdjevič et al., 2019). El objetivo del estudio actual es analizar la expresión de os genes que se expresan en la piel de trucha marrón, para identificar cuáles de ellos son exclusivos en las manchas rojas, y con esto, definir el perfil de expresión de los nuevos tipos de células pigmentarias, los eritróforos de tipo 2. La expresión de genes candidatos identificados en los análisis transcriptómicos se analizará en muestras de trucha marrón y en regiones de la piel de diferente color mediante qPCR. Se comparará el perfil de expresión de regiones de piel con distinta pigmentación con el fin de identificar los genes con un perfil de expresión diferente con respecto a otras regiones de la piel.