Optimización de la eficiencia reproductiva en cerdo ibérico

Abstract

[ES] El cerdo ibérico es una raza porcina autóctona de la península ibérica, especialmente adaptada a las condiciones geoclimáticas del suroeste español y con gran capacidad adipogénica. De hecho, es precisamente esta última característica la que permite la obtención de productos curados de máxima calidad y hace que sean animales muy valorados en el mercado. El aumento de la demanda de estos productos ha hecho aumentar el número de explotaciones intensivas. Sin embargo, en comparación con el porcino blanco la eficiencia reproductiva del cerdo ibérico es sensiblemente menor debido, principalmente, a su baja prolificidad. La prolificidad es un carácter regulado genéticamente y de gran importancia para la viabilidad económica del porcino, especialmente en ibérico. Hasta hace poco, en ibérico no había programas de mejora genética sistemáticos en los que la prolificidad fuese un objetivo claro de selección. Por tanto, esta raza sufre un retraso comparada con otras razas comerciales. Además, otro problema del cerdo ibérico es el bajo número de tetinas (casi fijado a diez) que dan importantes problemas de manejo en granjas de reproductoras donde se pretende aumentar la eficiencia reproductiva. En la última década los grandes avances en tecnologías de genotipado han permitido la posibilidad de realizar análisis de asociación del genoma completo (GWAS) en relación con caracteres fenotípicos complejos como, en este caso, los reproductivos. Este tipo de análisis permite la identificación de las variantes genéticas asociadas con el carácter de interés, sin restricciones en cuanto a la localización genómica de las mutaciones. La identificación de variantes asociadas a los caracteres reproductivos puede posibilitar su uso para seleccionar los progenitores de manera más eficiente y aumentar la respuesta a la selección de estos caracteres considerablemente. El objetivo de este trabajo es identificar regiones genómicas asociadas a los caracteres prolificidad y número de tetinas en cerdo ibérico a través de un análisis de asociación del genoma completo.

[EN] The Iberian pig is an autochthonous breed of the Iberian Peninsula, specially adapted to the geoclimatic conditions of the Spanish Southwest and with great adipogenic capacity. In fact, this last characteristic allows to obtain the cured products of the highest quality and makes them highly valued animals in the market. The increasing demand of these products has caused an increase on the number of reproductive intensive farms. However, in contrast to white pigs, the reproductive efficiency of the Iberian pig is significantly lower, mainly due to its low prolificacy. The prolificacy is a genetically regulated trait and of great importance for the economic viability of the pig production, especially in Iberian. Until recently, in Iberian pig there were no systematic genetic selection programs in which prolificacy was a clear objective of selection. Therefore, this breed suffers a delay compared to other commercial breeds. In addition, another problem of the Iberian pig is the low number of teats (almost set to ten) which gives important management problems in breeding farms with a better reproductive efficiency. In the last decade, the great advances in technologies of genotyping have allowed the possibility of carrying out genome wide association analysis (GWAS) with complex phenotypic traits as, in this case, the reproductive ones. This kind of analysis allows the identification of the genetic variants associated with the trait of interest, without restrictions regarding the genomic location of the mutations. The identification of variants associated with reproductive traits can make possible to use them for selecting parents more efficiently, so increasing considerably the response to the selection of traits. The objective of this work is to identify genomic regions associated with the prolificacy and number of nipple in Iberian pigs through genome wide association analysis.