Estudio para la mejora de producción en conejo de carne mediante el incremento del tamaño de camada

Abstract

[ES] Uno de los principales caracteres de mejora en especies prolíficas por su interés económico es el tamaño de camada, sin embargo, la respuesta a la selección por tamaño de camada ha sido baja. El objetivo de este estudio es identificar SNPs y zonas genómicas asociados al tamaño de camada para un futuro uso en la mejora de este carácter. Se genotiparon 184 hembras con un chip de ADN de alta densidad (200 K) para detectar SNPs. Las hembras procedían de un experimento de selección divergente por capacidad uterina. La capacidad uterina es un carácter muy relacionado con el tamaño de camada. Se registró el número de nacidos totales (NT), el número de nacidos vivos (NV), el peso de la camada de los nacidos vivos (PC), el número de gazapos vivos a la semana del nacimiento (NS1) y el número de gazapos destetados (ND) en los partos de las hembras. Para el análisis de asociación del genoma completo se utilizó el método Bayes B. Para la evaluación de la asociación entre cada SNP y los caracteres se calcularon los valores de los factores de Bayes. Se consideró que el polimorfismo era relevante cuando el factor de Bayes presentaba un valor igual o mayor a cinco. Se han detectado varias regiones genómicas de los cromosomas 13 y 17, asociadas al tamaño de camada al parto (número de nacidos totales y vivos), a la semana y al destete. Asimismo, estos dos cromosomas presentan regiones comunes para estos cuatro caracteres. Además de los cromosomas 13 y 17, hay una región en el cromosoma 15 que es particularmente importante para el peso de camada. No obstante, se debería de validar la existencia de estos polimorfismos en otras poblaciones antes de su posible utilización en los programas de mejora genética del conejo.

[EN] One of the main traits of improvement in prolific species due to its economic impact is the litter size, still, its selective breeding response has been low. The goal of this study is to identify SNPs and genomic areas associated to litter size, for future use in the improvement of this trait. 184 does were genotyped with a high density (200K) AND chip in order to detect SNPs. The does came from a divergent uterine capacity experiment. Uterine capacity is a trait very closely related with litter size. Total number born (NT), number born alive (NV), litter weight of the living (PC), number of kitten alive 1 week after birth (NS1) and number of weaned kitten (ND) were registered in the does¿ parities. For the genome wide association analysis, the Bayes B. method was used. In order to evaluate the association between each SNP and the traits registered the value of the Bayes Factors were calculated. Only when the Bayes Factor value was equal or higher than five was the polymorphism considered relevant. Multiple genomic regions in the chromosomes 13 and 17 related to litter size at birth (total number born and number born alive), number living after a week and number weaned were detected. Those 2 chromosomes also have areas related for those 4 traits. Besides chromosomes 13 and 17, there is an area in chromosome 15 that is especially important for litter weight. Nevertheless, the existence of these polymorphisms should be validated in other populations before its usage in rabbit genetic improvement plans.