Análisis molecular de XIST en cerdos deficientes en p53

Abstract

[ES] Los cerdos modificados genéticamente sirven como modelo animal para diferentes enfermedades, como el cáncer. En la mayoría de cánceres, el supresor tumoral p53, que es esencial para regular la reparación del ADN y la división celular, aparece mutado. Cuando se generan cerdos p53 KO, los machos nacen sin dificultades, pero las hembras mueren entre la tercera y cuarta semana de desarrollo fetal. Basándonos en el trabajo de Delbridge et al. (2019), nuestra hipótesis es que esta muerte relacionada con el género es causada por una inactivación anormal del cromosoma X, un mecanismo de compensación de dosis genética. El regulador principal de este proceso es XIST (transcrito específico del cromosoma X inactivo), por lo que su expresión está probablemente alterada. Sin embargo, este ARN largo no codificante no está caracterizado en cerdo, por lo tanto, tomando como referencia el contexto genómico de XIST caracterizado de otras especies, buscamos loci candidatos observando sus patrones de expresión. Hemos encontrado un potencial candidato, que aparentemente tiene un patrón de expresión que es dependiente de género y genotipo. En este proyecto, se ha realizado el análisis de expresión de nuestro candidato, en una amplia variedad de muestras.

[EN] Genetically modified pigs serve as animal models for different diseases, such as cancer. In most cancers, the tumour suppressor p53, which is essential for regulating DNA repair and cell division, is mutated. When generating p53 KO pigs, males are born normally, but females usually undergo developmental arrest around the third or fourth week of foetal development, and eventually die. Based on the work of Delbridge et al., (2019), our hypothesis is that this sex-related death is caused by abnormal X chromosome inactivation, a gene dosage compensation mechanism. The master regulator of this process is the X-inactive specific transcript, so its expression must be disrupted. However, this lncRNA is not characterized in pig, therefore by taking the genomic context of other species¿ characterized XIST as a reference, we search for candidate loci by observing their expression patterns. We have found a strong candidate, that apparently has an expression pattern dependant on gender and genotype. In this project, analysis of the expression of our candidate has been performed, in a wide variety of samples.