Structural characterization of FmtA: a new esterase from Staphylococcus aureus

Abstract

[ES] La FmtA es una proteína reconocedora de penicilina con una función esterasa que consiste en hidrolizar el enlace éster que une la D-alanina a la cadena principal de los ácidos teicoicos. Se trata de una proteína de interés porque actúa sobre los ácidos teicoicos y desempeña un papel clave en la síntesis de la pared celular bacteriana, lo que la sitúa en el punto de mira como posible diana terapéutica. El presente trabajo consiste en la expresión, purificación y cristalización de esta proteína con el fin de obtener -mediante cristalografía de rayos X- datos estructurales que permitan la elucidación estructural de la proteína. A partir de los datos de difracción obtenidos, se llevan a cabo ciclos de modelado y refinamiento del modelo estructural de FmtA para analizar la estructura de la proteína e identificar sus aspectos más relevantes. Se trata de un trabajo en colaboración con la Prof. Dasantila Golemi-Kotra, del Departamento de Biología de la Universidad York de Toronto (Canadá). Anteriormente la Prof. Golemi-Kotra resolvió una primera estructura de FmtA libre de ligandos a baja resolución, pero no pudo continuar la caracterización estructural porque los cristales no eran reproducibles. El trabajo actual pretende reproducir los cristales de FmtA para obtener datos de difracción a mayor resolución que nos permitan una comprensión más detallada de esta proteína diana.

[EN] FmtA is a penicillin-recognising protein with an esterase function that involves hydrolysing the ester bond linking D-alanine to the backbone of teichoic acids. It is a protein of interest because it acts on teichoic acids and plays a key role in bacterial cell wall synthesis, which places it in the spotlight as a potential therapeutic target. The present work consists of a scientific paper on the structural elucidation of FmtA. Throughout this work, this protein is expressed, purified and crystallised to elucidate the structure by X-ray crystallography. Based on the diffraction data obtained, cycles of model building and refinement of the structural model of FmtA are carried out to analyse the structure of the protein and identify its most relevant aspects. This is a collaborative work with Prof. Dasantila Golemi-Kotra, from the Department of Biology at York University in Toronto (Canada). Previously, Prof. Golemi-Kotra determined a first crystal structure of FmtA at low resolution and in the absence of ligands. However, further structural studies where hampered by the irreproducibility of the protein crystals. The current work aims to reproduce the FmtA crystals to obtain higher-resolution diffraction data, allowing us to comprehend this target protein in more detail.