Tutorial práctico para mapeo de QTLs

Abstract

El mapeo de loci de caracteres cuantitativos (QTLs) es una técnica eficaz para identificar regiones genéticas asociadas con caracteres complejos, potenciada por la disponibilidad de datos de genotipado y fenotipado de alto rendimiento. Sin embargo, su análisis puede ser complicado, especialmente con poblaciones experimentales no convencionales. R/qtl es una herramienta interactiva útil para este propósito, aunque su interfaz puede resultar complicada para principiantes. Por ello, se propone un tutorial práctico que cubre la preparación de datos, el uso de funciones y parámetros de R/qtl, y la selección de modelos adecuados. El tutorial incluye un ejemplo práctico con retrocruces avanzados de berenjena, que han sido fenotipados y genotipados. R/qtl proporciona resultados útiles como puntuaciones LOD y gráficos de efectos para QTLs identificados, facilitando la comprensión de la genética de caracteres complejos y apoyando programas de mejora y selección vegetal. El enfoque práctico del tutorial permitirá a los usuarios con poca experiencia en programación analizar sus datos y entender mejor los métodos de mapeo de QTL.