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Ensamblaje y mapeo de secuencias NGS utilizando Galaxy. Manejo de archivos SAM y BAM.

RiuNet: Repositorio Institucional de la Universidad Politécnica de Valencia

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Ensamblaje y mapeo de secuencias NGS utilizando Galaxy. Manejo de archivos SAM y BAM.

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Nombre: Cardona - Ensamblaje ...
Tamaño: 1.104Mb
Formato: PDF
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dc.contributor.author Cardona Serrate, Fernando es_ES
dc.date.accessioned 2024-06-20T22:12:11Z
dc.date.available 2024-06-20T22:12:11Z
dc.date.issued 2024-06-20T22:12:11Z
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10251/205352
dc.description.abstract En este artículo se describe paso a paso cómo analizar los datos de secuenciación de segunda generación, en concreto, cómo analizar los archivos de secuencia mapeados con el genoma de referencia (SAM o BAM) que obtenemos en secuenciación de nueva generación (NGS, de Next Generation Sequencing). Además, se estudia cómo se pueden visualizar y analizar su calidad, principalmente analizando la cobertura y la profundidad de lectura. Todo ello podemos hacerlo utilizando la herramienta Galaxy y sin necesidad de conocimientos bioinformáticos avanzados. es_ES
dc.language Español es_ES
dc.rights Reconocimiento (by) es_ES
dc.subject NGS (Next Generation Sequencing) es_ES
dc.subject Técnicas de secuenciación es_ES
dc.subject SAM (Sequence Alignment Map) es_ES
dc.subject BAM (Binary Alignment Map) es_ES
dc.subject Galaxy (computational biology) es_ES
dc.subject Genética es_ES
dc.subject Genómica es_ES
dc.subject Mapeo es_ES
dc.title Ensamblaje y mapeo de secuencias NGS utilizando Galaxy. Manejo de archivos SAM y BAM. es_ES
dc.type Objeto de aprendizaje es_ES
dc.lom.learningResourceType Artículo Docente es_ES
dc.lom.interactivityLevel Medio es_ES
dc.lom.semanticDensity Medio es_ES
dc.lom.intendedEndUserRole Alumno es_ES
dc.lom.context Ciclo superior es_ES
dc.lom.difficulty Dificultad media es_ES
dc.lom.typicalLearningTime 01 horas 30 minutos es_ES
dc.lom.educationalDescription Lectura comprensiva y puesta en práctica siguiendo los pasos indicados. es_ES
dc.lom.educationalLanguage Español es_ES
dc.upv.convocatoriaDocenciaRed 2023-2024 es_ES
dc.upv.ambito PUBLICO es_ES
dc.subject.unesco 2409 - Genética es_ES
dc.rights.accessRights Abierto es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural - Escola Tècnica Superior d'Enginyeria Agronòmica i del Medi Natural es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Departamento de Biotecnología - Departament de Biotecnologia es_ES
dc.description.bibliographicCitation Cardona Serrate, F. (2024). Ensamblaje y mapeo de secuencias NGS utilizando Galaxy. Manejo de archivos SAM y BAM. http://hdl.handle.net/10251/205352 es_ES
dc.description.accrualMethod DER es_ES
dc.relation.pasarela DER\38569 es_ES


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