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KOunt : A reproducible KEGG orthologue abundance workflow

RiuNet: Repositorio Institucional de la Universidad Politécnica de Valencia

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KOunt : A reproducible KEGG orthologue abundance workflow

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Mattock, J.; Martínez-Álvaro, M.; Cleveland, M.; Roehe, R.; Watson, M. (2023). KOunt : A reproducible KEGG orthologue abundance workflow. Bioinformatics. 39(8). https://doi.org/10.1101/2023.04.27.538265

Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: http://hdl.handle.net/10251/205642

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Nombre: MattockMartinez-A ...
Tamaño: 1.108Mb
Formato: PDF
Descripción: Versión editorial
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Metadatos del ítem

Título: KOunt : A reproducible KEGG orthologue abundance workflow
Autor: Mattock, Jennifer Martínez-Álvaro, Marina Cleveland, Matthew Roehe, Rainer Watson, Mick
Fecha difusión:
Resumen:
[EN] Accurate gene prediction is essential for successful metagenome analysis. We present KOunt, a Snakemake pipeline, that precisely quantifies KEGG orthologue abundance.
Palabras clave: KEGG orthologue , KOunt , Metagenome analysis
Derechos de uso: Reconocimiento (by)
Fuente:
Bioinformatics. (issn: 1367-4803 )
DOI: 10.1101/2023.04.27.538265
Editorial:
Oxford University Press
Versión del editor: https://doi.org/10.1101/2023.04.27.538265
Código del Proyecto:
info:eu-repo/grantAgreement/BBSRC//BB%2FS006567%2F1/
info:eu-repo/grantAgreement/BBSRC//BB%2FS006680%2F1/
Agradecimientos:
This work was supported by grants from the Biotechnology and Biological Sciences Research Council [BB/S006567/1 and BB/S006680/1].
Tipo: Artículo

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