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KOunt : A reproducible KEGG orthologue abundance workflow

RiuNet: Repositorio Institucional de la Universidad Politécnica de Valencia

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KOunt : A reproducible KEGG orthologue abundance workflow

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Nombre: MattockMartinez-A ...
Tamaño: 1.108Mb
Formato: PDF
Descripción: Versión editorial
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dc.contributor.author Mattock, Jennifer es_ES
dc.contributor.author Martínez-Álvaro, Marina es_ES
dc.contributor.author Cleveland, Matthew es_ES
dc.contributor.author Roehe, Rainer es_ES
dc.contributor.author Watson, Mick es_ES
dc.date.accessioned 2024-07-01T18:37:10Z
dc.date.available 2024-07-01T18:37:10Z
dc.date.issued 2023 es_ES
dc.identifier.issn 1367-4803 es_ES
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10251/205642
dc.description.abstract [EN] Accurate gene prediction is essential for successful metagenome analysis. We present KOunt, a Snakemake pipeline, that precisely quantifies KEGG orthologue abundance. es_ES
dc.description.sponsorship This work was supported by grants from the Biotechnology and Biological Sciences Research Council [BB/S006567/1 and BB/S006680/1]. es_ES
dc.language Inglés es_ES
dc.publisher Oxford University Press es_ES
dc.relation.ispartof Bioinformatics es_ES
dc.rights Reconocimiento (by) es_ES
dc.subject KEGG orthologue es_ES
dc.subject KOunt es_ES
dc.subject Metagenome analysis es_ES
dc.title KOunt : A reproducible KEGG orthologue abundance workflow es_ES
dc.type Artículo es_ES
dc.identifier.doi 10.1101/2023.04.27.538265 es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/BBSRC//BB%2FS006567%2F1/ es_ES
dc.relation.projectID info:eu-repo/grantAgreement/BBSRC//BB%2FS006680%2F1/ es_ES
dc.rights.accessRights Abierto es_ES
dc.description.bibliographicCitation Mattock, J.; Martínez-Álvaro, M.; Cleveland, M.; Roehe, R.; Watson, M. (2023). KOunt : A reproducible KEGG orthologue abundance workflow. Bioinformatics. 39(8). https://doi.org/10.1101/2023.04.27.538265 es_ES
dc.description.accrualMethod S es_ES
dc.relation.publisherversion https://doi.org/10.1101/2023.04.27.538265 es_ES
dc.type.version info:eu-repo/semantics/publishedVersion es_ES
dc.description.volume 39 es_ES
dc.description.issue 8 es_ES
dc.relation.pasarela S\509721 es_ES
dc.contributor.funder Biotechnological Science Research Council, Reino Unido es_ES


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