Análisis de la diversidad genética de una colección de variedades tradicionales de melón español

Abstract

[ES] Se estudió una colección de 51 accesiones de variedades tradicionales de melón de Murcia. Mediante la tecnología de genotipado masivo Sequenom Mass assay se genotiparon SNPs repartidos por todo el genoma del melón. Los resultados se compararon con los resultados de una colección nuclear de germoplasma de melón analizada previamente por el grupo de Mejora Genética de Cucurbitáceas del COMAVUPV. Esta colección nuclear incluía entradas de todas las variedades botánicas de melón. A través del análisis de componentes principales se evaluó la diversidad de la colección y sus relaciones genéticas con germoplasma variado de la especie. La mayoría de las entradas de la colección murciana se agruparon en dos grupos muy definidos: Piel de sapo y Tendral, pertenecientes a C.melo subsp melo var inodorus. El resto de entradas fueron muy variables, algunas presentaron similitud con genotipos de referencia y otras no, representando nuevos genotipos. La realización de genotipos gráficos de varias entradas permitió visualizar la variación a nivel genómico. Se identificó variabilidad en algunos grupos de ligamiento, mientras que otros se mantenían uniformes. Es de particular interés que en algunas de las regiones variables de las entradas de la colección murciana se han descrito QTLs relacionados con la calidad del fruto

[ES] A collection of 51 accessions of melon landraces from Murcia was studied. SNPs evenly distributed throughout the melon genome were genotyped by the Sequenom genotyping technology. Results were compared to those obtained from a germplasm core collection previously analyzed by the COMAV-UPV Cucurbits Breeding Group. This core collection includes most of the melon botanical varieties. A Principal component analysis was conducted to study the collection's diversity and to evaluate the genetic relationships of the Murcian collection with the core collection. Most accessions from the Murcian collection fell into two main groups: Piel de sapo and Tendral, both belonging to C.melo subsp. melo var inodorus. The rest of the accessions were considerably variable. Certain accessions were fairly similar to reference genotypes while others were not. Genome-wide variability was assessed through graphical genotypes of various accessions. Variability in certain linkage groups was observed, while others were genetically uniform. It is particularly interesting that amongst some of the variable regions found within the accessions of the Murcian collection, QTLs related to fruit quality traits have been identified.