Evolución de las regiones reguladoras de la transcripción en el complejo de Mycobacterium tuberculosis

Abstract

[ES] La bacteria de la tuberculosis mata a más de un millón y medio de personas al año y representa un problema de salud global. Las técnicas genómicas están permitiendo entenderla mejor de tal manera que la cantidad de datos genómicos, transcriptómicos, proteómicos y metabolómicos ha ido aumentando. Puesto que es una enfermedad global, la bacteria que la causa es también heterogénea. Recientemente, en el laboratorio se ha caracterizado a nivel genómico una colección global de cepas de tuberculosis. Esto nos ha dado un arsenal de polimorfismos presentes en las cepas circulantes de todo el mundo que pueden tener un impacto en el fenotipo (diferencias en expresión génica y proteica, epidemiología, presentación clínica). Particularmente muchos de esos polimorfismos afectan zonas reguladoras de la transcipción. Para empezar a entender ese impacto se propone este trabajo de investigación. El hecho de que dichas zonas estén o no conservadas a nivel global puede indicar su importancia para la virulencia y el desarrollo de la enfermedad. En este trabajo se plantea estudiar dichas regiones. Para ello, se han identificado diferentes elementos reguladores (sitios de unión de factores de transcripción, regiones de inicio de la transcripción y la traducción así como ARNs pequeños). Usando la información de mutaciones acumuladas en nuestra muestra genómica global clasificaremos dichas regiones como esenciales (conservadas evolutivamente) y no esenciales.

[EN] Mycobacterium tuberculosis is a bacterium that kills more than one and a half million people each year, constituting a global health issue. Modern genomic techniques are allowing to understand it better, so the amount of genomic, transcriptomic, proteomic and metabolomic data is constantly rising. As it is a global disease, bacteria which cause it are heterogeneous. Recently, a global collection of M. tuberculosis strains has been characterized in the lab, providing us with a vast set of polymorphisms present in the different strains which could have a great impact on their phenotype and clinical presentation or epidemiology. Particularly lots of these polymorphisms affect transcriptional regulatory regions in the genome. This work’s goal is to begin understanding that impact studying those regions. For that purpose, different regulatory regions have been identified and using the information stacked in the global sample of strains, we can classify them as essential (evolutionarily conserved) or nonessential.