Caracterización y efecto de TRIM29 en líneas celulares de cáncer de mama triple negativo

Abstract

[ES] La recaída en cáncer de mama es una de las mayores causas de morbilidad en pacientes que desarrollan la enfermedad y, de ellas, entre un 15-20% poseerán tumores de mama triple negativo. La mortalidad de pacientes con cáncer de mama TN es considerablemente mayor si se compara con otros tumores mamarios. Es por ello que existe la necesidad y el interés de encontrar nuevas dianas susceptibles de tratamiento en pacientes con cáncer de mama TN. Trabajos previos del equipo basados en BAC microarrays (aCGH) examinaron la asociación entre alteraciones en los cambios del número de copias del ADN y la evolución clínica en 185 pacientes con cáncer de mama de bajo riesgo. Como resultado, se describió que aquellos pacientes cuyos tumores tenían delecionada la región genómica 11q21-q25 presentaban un mayor índice de recaída en ausencia de tratamiento con quimioterapia. El objetivo del trabajo es la caracterización del gen TRIM29, localizado en la región 11q21-q25 que se vio delecionada en las muestras de pacientes. Para ello, se llevarán a cabo los siguientes procedimientos experimentales: - Se examinarán los efectos de la expresión de TRIM29 en las líneas de cáncer de mama TN de las que dispone el equipo (HCC1500, HCC3153, MDAMB231, MDAMB435 y BT549). Para ello, previamente, se comprobará si se correlacionan los niveles de expresión con el número de copias de los genes mediante FISH, PCR cuantitativa y Western Blot. - Se utilizarán líneas celulares con la expresión de TRIM29 modificada mediante shRNA y/o mediante la técnica CRISPR/Cas9 para examinar su afectación a los niveles de proliferación, invasión y migración celular.

[EN] Breast cancer is the most common tumor among women worldwide, running as the second leading cause of cancer death in women in developed countries and the first in underdeveloped countries. The last decade has brought a breakthrough that have allowed a better molecular classification of the multiple subtypes of breast cancer, laying the groundwork to combat the great heterogeneity of breast tumors by using new targeted treatments. Within the diversity of breast carcinomas, triple negative breast tumors are the most aggressive, where more than 70% of patients will develop metastases and, despite treatment with chemotherapy, will succumb to the disease months later. TRIM29 has been postulated as a possible candidate gene susceptible of therapy in various cancers, especially breast, where the deletion of the 11q21-q25 region of the genome harboring the gene, has been associated with a worse prognosis and a higher relapse rate. Previous bioinformatics work and gene network analysis have associated the expression of TRIM29 with a number of genes whose function may depend on the presence or absence of our candidate gene. On the one hand, this project has carried out the TRIM29 characterization in four TN breast cancer cell lines using various techniques such as copy-number variation (CNV), Fluorescence In Situ Hybridization (FISH) or expression (TaqMan and Western Blot ). Secondly, it has carried out the modification of the expression of TRIM29 in cell lines, inducing overexpression of TRIM29 in the lines that do not express the gene naturally and silencing TRIM29 in those lines that express the gene under normal conditions. Finally, we have sought the correlation between TRIM29 and other genes involved in key processes for the initiation, development and susceptibility to treatment of the disease.