Alteraciones en la comunicación entre rutas de señalización: un estudio transversal en cáncer

Abstract

[ES] El cáncer se describe como un conjunto de enfermedades caracterizadas por un desarrollo tisular incontrolado, donde las células afectadas consiguen evadir los mecanismos intrínsecos de control frente a la muerte celular o la proliferación controlada. Se trata de enfermedades multi-génicas donde una serie de mutaciones en genes clave se encargan de dirigir el proceso de desarrollo tumoral.

En este contexto, la biología de sistemas aporta el marco idóneo para el estudio del cáncer ya que permite describir las alteraciones en la función biológica como cambios en el sistema, más allá de los elementos individuales afectados. De especial relevancia lo constituye el estudio de las rutas de señalización ya que se implican en funciones esenciales como el ciclo celular.

Este trabajo se centra en el estudio de las rutas de señalización y de sus alteraciones en un conjunto amplio de cánceres recopilados a través de dos consorcios internacionales (TCGA e ICGC).

La metodología de análisis empleada descompone el conjunto de rutas en cascadas de señalización encargadas de llevar a cabo funciones específicas. De especial relevancia dentro del trabajo supondrá determinar qué cambios se producen en la comunicación entre cascadas con funciones relacionadas a consecuencia de la enfermedad, así como de otros parámetros más específicos como el subtipo tumoral, el estadío o la probabilidad de supervivencia.

[EN] Cancer is described as a set of diseases characterized by uncontrolled tissue development, where the affected cells evade the intrinsic control mechanisms against cell death or controlled proliferation. Those are multi-gene diseases where a series of mutations in key genes are responsible for the direction of the tumor development process.

In this context, systems biology provides the ideal framework for the study of cancer because it allows to describe biological function alterations as changes in the system, beyond the individual elements affected. Of particular relevance is the study of signaling pathways as they are involved in essential functions such as cell cycle.

This work focuses on the study of signaling pathways and their changes in a wide range of cancers collected through two international consortia (TCGA and ICGC).

The used methodology of analysis decomposes the set of pathways in signaling cascades responsible for carrying out specific functions. Of particular relevance in the work will be the determination of communication changes between cascades with related functions as a result of the disease, as well as other specific parameters such as tumor subtype, stage or survival chance.