HTG EdgeSeq: un nuevo abordaje en la determinación del perfil molecular de tumores de cáncer de ovario

Abstract

[ES] Con el objetivo de ampliar nuestro conocimiento en la comprensión de una enfermedad tan compleja y heterogénea como es el cáncer de ovario, se propone el uso de una nueva tecnología genómica, el HTG EdgeSeq, en la determinación del perfil molecular de muestras de tumores ováricos incluidas en parafina (FFPE). El empleo de HTG EdgeSeq se basa en el análisis completo de 2545 genes (Oncology Biomarker Panel) empleando una librería de sondas específicas y posterior acoplamiento a NGS que van a permitir la obtención de perfiles cuantitativos de expresión a partir de volúmenes de muestra realmente pequeños. La información digitalizada obtenida de diferentes pacientes servirá para facilitar la identificación de biomarcadores específicos asociados a este tipo de cáncer, mejorando así el diagnóstico y la clasificación de los diferentes subtipos de cáncer de ovario para la orientación pronóstica y predictiva de tratamiento con agentes que dañan el ADN.

[EN] In order to expand our knowledge in the understanding of a complex and heterogeneous disease such as ovarian cancer, we propose the use of a new genomic technology, the HTG EdgeSeq, in the determination of the molecular profile of paraffin embebedded ovarian tumor samples (FFPE). The use of HTG EdgeSeq is based on the complete analysis of 2545 genes (Oncology Biomarker Panel) using a library of specific probes and subsequent coupling to NGS that will allow the obtaining of quantitative expression profiles from really small sample volumes. Digitized information obtained from different patients will facilitate the identification of specific biomarkers associated with this type of cancer, thus improving the diagnosis and classification of different subtypes of ovarian cancer for the prognostic and predictive orientation of treatment with agents that damage the DNA.