[EN] Patients with liver cirrhosis may develop covert or minimal hepatic encephalopathy (MHE). Hyperammonemia (HA) and peripheral inflammation play synergistic roles in inducing the cognitive and motor alterations in MHE. ...
[EN] T-cell receptor (TCR) analysis is relevant for the study of immune system diseases. The expression of TCRs is usually measured with targeted sequencing approaches where TCR genes are selectively amplified. However, ...
Conesa, Ana; Madrigal, Pedro; Tarazona Campos, Sonia; Gómez Cabrero, David; Cervera, Alejandra; McPherson, Andrew; Wojciech Szczesniak, Michal; Gaffney, Daniel J.; Elo, Laura L.; Zhang, Xuegong; Mortazavi, Ali(BioMed Central, 2016-01)
[EN] RNA-sequencing (RNA-seq) has a wide variety of
applications, but no single analysis pipeline can be
used in all cases. We review all of the major steps in
RNA-seq data analysis, including experimental design,
quality ...
[EN] Alternative splicing (AS) is a highly-regulated post-transcriptional mechanism known to modulate isoform expression within genes and contribute to cell-type identity. However, the extent to which alternative isoforms ...
Nieto Romero, María Camila(Universitat Politècnica de València, 2023-04-21)
[ES] El microbioma humano constituye el conjunto de microorganismos (bacterias, arqueas, virus, hongos y protistas) que están en nuestro cuerpo, y se ha demostrado en múltiples investigaciones el rol fundamental que tiene ...
Porlán Miñarro, Antonio(Universitat Politècnica de València, 2021-10-08)
[ES] El parto prematuro está asociado a resultados adversos en el desarrollo del neonato. En este aspecto, la leche materna y su composición juegan un papel importante en el correcto desarrollo del neonato, ya que es un ...
Martorell Marugán, Jordi(Universitat Politècnica de València, 2015-09-04)
[ES] Los avances en tecnologías de secuenciación masiva han dado lugar al desarrollo de la transcriptómica por secuenciación, que permite analizar la expresión de genes e isoformas. El laboratorio de Genómica de la Expresión ...
Villacampa Fernández, Marina(Universitat Politècnica de València, 2019-09-05)
[ES] Las levaduras en un sistema de crecimiento continuo, de alta densidad y con una
concentración de glucosa baja tienen un ciclo robusto de 4-5 horas (ciclo metabólico de la
levadura, o YMC del inglés Yeast Metabolic ...
[EN] Understanding the cause of sex disparities in COVID-19 outcomes is a major challenge. We investigate sex hormone levels and their association with outcomes in COVID-19 patients, stratified by sex and age. This ...
Gimeno Almiñana, Gracia(Universitat Politècnica de València, 2023-09-20)
[ES] En una planta de embalajes se detectan retrasos en la gestión de pedidos. Se observa que la comunicación entre los distintos departamentos encargados del proceso es ineficiente, y hay repetición de información en ...
Aguerralde Martin, Maider(Universitat Politècnica de València, 2023-01-09)
[ES] Actualmente, el melanoma es el principal causante de muerte por cáncer de la piel. No todos los melanomas se comportan igual, por lo que es de interés disponer de una clasificación de los mismos que permita precisar ...
Alós Maldonado, Raúl(Universitat Politècnica de València, 2023-10-27)
[ES] Los datos multiómicos, esto es, bases de datos de alta dimensionalidad formadas por bloques de variables, comúnmente atribuidos a información biológica y clínica en pacientes, se emplean cada vez más en la investigación ...
Tarazona Campos, Sonia; Furió Tarí, Pedro; Turrà, David; Di Pietro, Antonio; Nueda, María José; Ferrer, Alberto; Conesa, Ana(Oxford University Press (OUP), 2015-12-02)
[EN] As the use of RNA-seq has popularized, there is an increasing consciousness of the importance of experimental design, bias removal, accurate quantification and control of false positives for proper data analysis. We ...
Tarazona Campos, Sonia; García-Alcalde, Fernando; Dopazo, Joaquín; Ferrer Riquelme, Alberto José; Conesa, Ana(Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2011-09-08)
Next-generation sequencing (NGS) technologies are revolutionizing genome research, and in particular, their application to transcriptomics (RNA-seq) is increasingly being used for gene expression profiling as a replacement ...
Palomar-Abril, V.; Soria-Comes, T.; Tarazona Campos, Sonia; Ureste, M. M.; Giner-Bosch, Vicent; Maiques, I. C. M.(Springer-Verlag, 2020-12)
[EN] Purpose Locally advanced non-small cell lung cancer (LA-NSCLC) is frequently treated with chemoradiotherapy (CRT). Despite the efforts, long-term outcomes are poor, and novel therapies have been introduced to improve ...
Sánchez Gaya, Víctor(Universitat Politècnica de València, 2017-09-05)
[ES] El enfoque multiómico está ganando terreno en el campo de la biología de sistemas, ya
que permite estudiar aspectos complementarios del funcionamiento de un sistema biológico. Sin
embargo, la integración de datos ...
Rodríguez Hernández, Zulema(Universitat Politècnica de València, 2021-04-21)
[ES] La hiperamonemia resultante de deficiencias hereditarias de las enzimas del ciclo de la urea o de la insuficiencia hepática crónica, ya sea de etiología alcohólica o no alcohólica, da como resultado un aumento de la ...
[EN] Pneumocystis species are ascomycete fungi adapted to live inside the lungs of mammals. These ascomycetes show extensive stenoxenism, meaning that each species of Pneumocystis infects a single species of host. Here, ...
[EN] The differentiation of self-renewing progenitor cells requires not only the regulation of lineage- and developmental stage-specific genes but also the coordinated adaptation of housekeeping functions from a metabolically ...
Galvez-Fernandez, Marta; Sanchez-Saez, Francisco; Domingo-Relloso, Arce; Rodríguez-Hernández, Zulema; Tarazona, Sonia; Gonzalez-Marrachelli, Vannina; Grau-Perez, Maria; Morales-Tatay, José M.; Amigo, Nuria; Garcia-Barrera, Tamara; Gomez-Ariza, Jose L.; Chaves, F. Javier; Garcia-Garcia, Ana Barbara; Melero, Rebeca; Tellez-Plaza, Maria(Elsevier, 2022-06)
[EN] Background: Limited studies have evaluated the joint influence of redox-related metals and genetic variation on metabolic pathways. We analyzed the association of 11 metals with metabolic patterns, and the interacting ...