IIdentificación de nuevos biomarcadores genéticos en neuroblastoma a través del análisis de los perfiles pangenómicos

Abstract

[ES] El neuroblastoma es el tumor sólido extracraneal más común durante la infancia y deriva de las células precursoras del sistema nervioso simpático. Es el responsable del 15% de muertes en niños con cáncer y se caracteriza por ser una enfermedad con una gran heterogeneidad clínica, genética, histológica y biológica. Los factores pronósticos considerados en la estratificación de riesgo pretratamiento de los pacientes son: el estadio, la edad, la histopatología (categoría y grado de diferenciación), la ploidía y alteraciones cromosómicas específicas como la amplificación del gen MYCN y la deleción del brazo cromosómico 11q; de esta forma, se clasifica a los pacientes según su riesgo de muerte en los grupos: Muy Bajo, Bajo, Intermedio y Alto (Very Low, Low, Intermediate y High Risk). El laboratorio de la Dra. Rosa Noguera está llevando a cabo un proyecto en el que se analizan los perfiles pangenómicos obtenidos mediante arrays de SNPs (Single Nucleotide Polimorfisms). En este trabajo, colaboré en el estudio de 195 tumores neuroblásticos, para evaluar el número total de alteraciones cromosómicas segmentarias, la localización cromosómica de estas alteraciones, y el tamaño total de material genético ganado y perdido, así como la presencia de alteraciones focales (bien en amplificaciones o bien en ganancias o pérdidas) y alteraciones cromosómicas numéricas. El objetivo fue determinar si existía una asociación entre la cantidad de material genético ganado y/o perdido (en kilobases) y el número de alteraciones segmentarias o numéricas cromosómicas. Consideramos que relacionando estos resultados con la clínica de los pacientes y el riesgo de recaída o muerte podemos contribuir en el desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas en neuroblastoma.

[EN] Neuroblastoma is the most common extracranial solid tumor during childhood and is derived from the precursor cells of the sympathetic nervous system. It is responsible for 15% of deaths in children with cancer and is characterized as a disease with great clinical, genetic, histological and biological heterogeneity. The prognostic factors considered in the pretreatment risk stratification of patients are: stage, age, histopathology (category and degree of differentiation), ploidy and specific chromosomal alterations such as the amplification of the MYCN gene and the deletion of the 11q chromosome arm; in this way, patients are classified according to their risk of death in the Very Low, Low, Intermediate and High Risk. The laboratory of Dr. Rosa Noguera carries out a project in which the pangenomic profiles obtained by arrays of SNPs (Single Nucleotide Polimorfisms) are analyzed. In this work, I will collaborate in the study of 195 neuroblastic tumors, to evaluate the total number of segmental chromosomal alterations, the chromosomal location of these alterations, and the total size of genetic material gained and lost, as well as the presence of focal alterations (well in amplifications or gains or losses) and numerical chromosomal alterations. The objective is to determine if there is an association between the amount of genetic material gained and/or lost (in kilobases) and the number of chromosomal segmental or numerical alterations. We believe that by relating these results to the patients' clinic and the risk of relapse or death we can contribute to the development of new therapeutic strategies in neuroblastoma.