Bioprospección en depósitos de combustible e identificación de especies microbianas con posible capacidad degradadora de hidrocarburos

Abstract

[ES] Debido a la creciente preocupación por la gestión y eliminación de residuos procedentes del uso de hidrocarburos como combustibles, cada vez más estudios se centran en la búsqueda de procedimientos eficaces con el fin de paliar este problema. En este trabajo, se propone una solución desde el punto de vista de la biorremediación, con el fin de reducir o eliminar los residuos resultantes del uso de hidrocarburos en la automoción. Partiendo de la biomasa presente en la superficie de depósitos de coche, se ha analizado y descrito por primera vez el microbioma que coloniza estos ambientes, mediante técnicas de análisis de secuenciación masiva. Así como también, las muestras se han sometido a un cultivo enriquecido con diésel o gasolina durante cuatro semanas, con el fin de analizar los cambios que ocurren en la composición microbiana ante una presión de selección. El microbioma que habita en los depósitos ha resultado ser muy diverso, donde el filo Proteobacteria ha resultado ser el dominante en todas las muestras. Tras el cultivo con presión de selección, el género Pseudomonas obtuvo un notable aumento en abundancia relativa, en las muestras enriquecidas con diésel. Finalmente, se estableció una colección de cepas bacterianas cultivables en placa procedentes de los caldos de cultivo enriquecidos, identificadas por el gen codificante de rRNA 16S. El género Pseudomonas fue al que más cepas aisladas pertenecieron. Así como también, destacaron los géneros Stenotrophomonas, Staphylococcus y Bacillus, entre otros. Queda así demostrado que la biorremediación de estos ambientes mediante la utilización de especies capaces de metabolizar estos hidrocarburos, es una solución con gran potencial para eliminar estos compuestos tan recalcitrantes.

[EN] Due to the growing concern about the management and disposal of waste from the use of hydrocarbons as fuels, more and more studies are being focused on the research for effective procedures to put an end to this problem. In this work, we propose a solution from the point of view of bioremediation, in order to reduce or eliminate the resulting waste from the use of hydrocarbons in the automotive industry. Starting from the biomass present in the surface of car deposits, the microbiome that colonizes these environments has been analyzed and described for the first time, by Next Generation Sequencing (NGS) techniques. As well as, the samples have been subjected to an enriched culture with diesel or gasoline for four weeks, in order to analyze the changes that occur in the microbial composition before a selection pressure. The microbiome that inhabits the deposits has turned out to be very diverse, where the Proteobacteria phylum has turned out to be the dominant one in all the samples. After cultivation with selection pressure, the genus Pseudomonas obtained a remarkable increase in relative abundance in the samples enriched with diesel. Finally, a collection of platable bacterial strains from the enriched culture broths, identified by the gene coding for 16S rRNA, was established. The genus Pseudomonas was the one that most isolated strains belonged to. Also, genus as Stenotrophomonas, Staphylococcus and Bacillus were found, among others. It is thus demonstrated that the bioremediation of these environments through the use of species capable of metabolizing these hydrocarbons, is a solution with great potential to eliminate these recalcitrant compounds.