Evaluación del papel pronóstico de las proteínas PIWI en cáncer mediante una estrategia in silico

Abstract

[ES] El cáncer es un conjunto de enfermedades que se caracteriza por el crecimiento y proliferación descontrolada de un grupo de células y una posterior diseminación a otros tejidos del organismo. Su origen es genético debido a que las alteraciones que contribuyen a la aparición de esta enfermedad afectan principalmente a tres tipos de genes: oncogenes, genes supresores de tumores y genes reparadores de DNA. Además, esta enfermedad se ha posicionado en el primer puesto de causas de mortalidad en países desarrollados, siendo el cáncer de pulmón, en concreto el cáncer de pulmón de células no pequeñas, el más común. Por ello, se requiere el descubrimiento y desarrollo de nuevas estrategias clínicas para mejorar su detección y así determinar su estadio, con el fin de mejorar la eficacia de los tratamientos convencionales. En esta línea de investigación juegan un papel importante las herramientas bioinformáticas, pues facilitan el análisis e interpretación de datos ómicos depositados en los distintos repositorios públicos.

En el presente trabajo se evalúa el papel pronóstico de una familia de proteínas, denominadas PIWI, en la detección de cáncer. La elección de estas proteínas se basa en estudios emergentes que las muestran como potenciales biomarcadores potenciales del cáncer puesto que se han correlacionado sus niveles de expresión con los diversos mecanismos subyacentes al cáncer. Para realizar esta caracterización de las proteínas PIWI, se ha diseñado y llevado a cabo una estrategia in silico, basada en la revisión de información contenida en recursos y bases de datos en cáncer. A continuación, se evaluó esta información, específicamente en las proteínas PIWI de una selección de estudios de adenocarcinoma de pulmón. El metaanálisis de estos resultados nos ha proporcionado una mayor claridad en el papel pronóstico de estos biomarcadores oncológicos.

[EN] Cancer is a group of diseases characterized by uncontrolled growth, proliferation and spread of abnormal cells. Its origin is genetic due to mutations that alter in three genes: oncogenes, tumour suppressor genes and DNA repair genes. Nowadays, cancer is considered the number one cause of mortality in developed countries, the most common is lung cancer, especially non-small cell lung cancer. Discovery and development of new clinical strategies is crucial to improve the detection and stage identification of cancer. The aim of this is to improve the efficacy of the conventional methods. In this field, the role of Bioinformatics is quite relevant, since it allows a better analysis and interpretation of omic data, available in different open-source repositories.

In the present work, the prognostic role of family proteins, called PIWI, is evaluated for cancer detection. Due to the volume of emerging studies correlation PIWI proteins gene expression levels with underlaying mechanism of cancer, these proteins are potential biomarkers in cancer. The characterization of these proteins has been performed via in silico strategy, based on data review in cancer webtools and databases. Besides, this information has been evaluated and compared to various studies of lung adenocarcinoma. Results suggest the down-regulated expression of PIWIL4 as prognostic biomarker in cancer.