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Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research

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Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research

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Conesa, A.; Götz, S.; Garcia-Gomez, JM.; Terol, J.; Talón, M.; Robles Viejo, M. (2005). Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research. Bioinformatics. 21(18):3674-3676. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti610

Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: http://hdl.handle.net/10251/151293

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[Cerrado]
Nombre: Conesa;Götz;Garci ...
Tamaño: 126.2Kb
Formato: PDF
Descripción: Versión editorial
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Metadatos del ítem

Título: Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research
Autor: Conesa, Ana Götz, Stefan Garcia-Gomez, Juan M Terol, Javier Talón, Manuel Robles Viejo, Montserrat
Entidad UPV: Universitat Politècnica de València. Departamento de Física Aplicada - Departament de Física Aplicada
Fecha difusión:
Resumen:
[EN] We present here Blast2GO (B2G), a research tool designed with the main purpose of enabling Gene Ontology (GO) based data mining on sequence data for which no GO annotation is yet available. B2G joints in one application ...[+]
Palabras clave: Gene-Ontology
Derechos de uso: Cerrado
Fuente:
Bioinformatics. (issn: 1367-4803 )
DOI: 10.1093/bioinformatics/bti610
Editorial:
Oxford University Press
Versión del editor: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti610
Código del Proyecto:
info:eu-repo/grantAgreement/EC/FP6/503094/EU/WEB ACCESSIBLE MR DECISION SUPPORT SYSTEM FOR BRAIN TUMOUR DIAGNOSIS AND PROGNOSIS, INCORPORATING IN VIVO AND EX VIVO GENOMIC AND METABOLIMIC DATA/ETUMOUR/
info:eu-repo/grantAgreement/MICYT//GEN2001-4885-C05-03/ES/ESTUDIO DE LOS FACTORES IMPLICADOS EN EL DESARROLLO Y CALIDAD DEL FRUTO DE LOS CITRICOS MEDIANTE GENOMICA FUNCIONAL/
info:eu-repo/grantAgreement/ISCIII//G03%2F160/
Agradecimientos:
The authors thank Dr Timothy Williams for fruitful discussions andcomments on the software and Nils Bluethgen for kindly providingthe Gossip software and supporting integration in B2G. This workhas been funded by MCyT (GEN ...[+]
Tipo: Artículo

References

Al-Shahrour, F., Diaz-Uriarte, R., & Dopazo, J. (2004). FatiGO: a web tool for finding significant associations of Gene Ontology terms with groups of genes. Bioinformatics, 20(4), 578-580. doi:10.1093/bioinformatics/btg455

Ashburner, M., Ball, C. A., Blake, J. A., Botstein, D., Butler, H., Cherry, J. M., … Sherlock, G. (2000). Gene Ontology: tool for the unification of biology. Nature Genetics, 25(1), 25-29. doi:10.1038/75556

Doniger, S. W., Salomonis, N., Dahlquist, K. D., Vranizan, K., Lawlor, S. C., & Conklin, B. R. (2003). Genome Biology, 4(1), R7. doi:10.1186/gb-2003-4-1-r7 [+]
Al-Shahrour, F., Diaz-Uriarte, R., & Dopazo, J. (2004). FatiGO: a web tool for finding significant associations of Gene Ontology terms with groups of genes. Bioinformatics, 20(4), 578-580. doi:10.1093/bioinformatics/btg455

Ashburner, M., Ball, C. A., Blake, J. A., Botstein, D., Butler, H., Cherry, J. M., … Sherlock, G. (2000). Gene Ontology: tool for the unification of biology. Nature Genetics, 25(1), 25-29. doi:10.1038/75556

Doniger, S. W., Salomonis, N., Dahlquist, K. D., Vranizan, K., Lawlor, S. C., & Conklin, B. R. (2003). Genome Biology, 4(1), R7. doi:10.1186/gb-2003-4-1-r7

Groth, D., Lehrach, H., & Hennig, S. (2004). GOblet: a platform for Gene Ontology annotation of anonymous sequence data. Nucleic Acids Research, 32(Web Server), W313-W317. doi:10.1093/nar/gkh406

Khan, S., Situ, G., Decker, K., & Schmidt, C. J. (2003). GoFigure: Automated Gene OntologyTM annotation. Bioinformatics, 19(18), 2484-2485. doi:10.1093/bioinformatics/btg338

Martin, D. M., Berriman, M., & Barton, G. J. (2004). BMC Bioinformatics, 5(1), 178. doi:10.1186/1471-2105-5-178

Zehetner, G. (2003). OntoBlast function: from sequence similarities directly to potential functional annotations by ontology terms. Nucleic Acids Research, 31(13), 3799-3803. doi:10.1093/nar/gkg555

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