Introducción al software TASSEL para el análisis masivo de datos de genotipado

Abstract

Un paso esencial en muchos proyectos de investigación genética es el genotipado de las muestras humanas, animales, vegetales o microbianas que se están estudiando. Las tecnologías de genotipado se basan en la identificación de diferencias entre las secuencias genómicas que puedan dar lugar a cambios importantes en el fenotipo. Como resultado, las plataformas de genotipado de alto rendimiento generan una enorme cantidad de información, para cuyo correcto análisis se requieren algunos fundamentos de bioinformática y Big Data. Existen diferentes programas informáticos para el análisis masivo de datos brutos, pero a menudo se basan en líneas de comandos, que distan mucho de ser intuitivas. En este artículo vamos a utilizar el software Trait Analysis by aSSociation, Evolution and Linkage (TASSEL), ya que es una herramienta muy útil y fácil de usar que permite un análisis visual de las secuencias genotipadas.