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Control de calidad y limpieza de secuencias NGS utilizando Galaxy. Manejo de archivos FASTQ.

RiuNet: Repositorio Institucional de la Universidad Politécnica de Valencia

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Control de calidad y limpieza de secuencias NGS utilizando Galaxy. Manejo de archivos FASTQ.

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Cardona Serrate, F. (2024). Control de calidad y limpieza de secuencias NGS utilizando Galaxy. Manejo de archivos FASTQ. http://hdl.handle.net/10251/205347

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Nombre: Cardona - Control ...
Tamaño: 1.022Mb
Formato: PDF
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Metadatos del ítem

Título: Control de calidad y limpieza de secuencias NGS utilizando Galaxy. Manejo de archivos FASTQ.
Autor: Cardona Serrate, Fernando
Entidad UPV: Universitat Politècnica de València. Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural - Escola Tècnica Superior d'Enginyeria Agronòmica i del Medi Natural
Universitat Politècnica de València. Departamento de Biotecnología - Departament de Biotecnologia
Fecha difusión:
Resumen:
A lo largo de este objeto de aprendizaje se estudia qué formato tienen los archivos de secuencia FASTQ, además de cómo se puede analizar y mejorar su calidad, por filtrado o recorte, para su mapeo posterior, todo ello ...[+]
Palabras clave: Galaxy (computational biology) , Génomica , FASTQ , FASTQC , Filtering , Trimming
Código UNESCO: 2409 - Genética
Derechos de uso: Reconocimiento (by)
Tipo: Objeto de aprendizaje
Tipo de recurso educativo: Artículo Docente
Descripción acerca del uso: Tras analizar inicialmente la calidad del archivo FASTQ, si esta no es adecuada para continuar con el análisis, puede mejorarse mediante filtering y/o trimming. Posteriormente, es necesario volver a analizar la calidad de los archivos para continuar con los análisis posteriores.
Destinatario: Alumno
Contexto: Ciclo superior
Dificultad: Dificultad media
Nivel de interactividad: Medio
Densidad semántica: Medio
Tiempo típico: 01 horas 30 minutos
Idioma del destinatario: Español
Permiso de acceso: PUBLICO

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