Caracterització molecular d'una colecció d'especies silvestres relacionades amb l'albergnia (S. melongena) emprant les noves tecnologíes de següenciació

Abstract

[CA] L’albergínia (Solanum melongena) ha sigut cultivada durant segles a tot arreu del món i actualment és un dels cultius amb més importància econòmica. La relació entre la versió salvatge, semi-domèstica i cultivada de Solanum melongena ha sigut sempre motiu de controvèrsia. És versemblant que l’albergínia que es consumeix en l’actualitat siga conseqüència de la domesticació de l’espècie silvestre Solanum incanum. Per una altra part, la existència d’una successió continua de formes fa que els límits entre taxons moltes vegades no siga massa clar entre albergínia i les seues espècies relacionades. La domesticació de les espècies cultivades ha provocat un empobriment genètic fins al punt en que l’albergínia d’avui dia és susceptible a nombroses malalties i plagues. És en aquest context on les espècies silvestres relacionades tenen un paper interessant, i és que aquestes han mostrat ser una reserva important de variabilitat genètica i variació al·lèlica per a caràcters d’interès agronòmic i característiques qualitatives tant de la planta com del fruit. La caracterització molecular detallada de col·leccions de germoplasma ens permetrà estudiar la diversitat a més de permetre’ns identificar accessions potencialment interessants per a la selecció i millora a banda de l’elaboració d’estratègies per a la conservació i maneig del germoplasma. En aquest treball s’han caracteritzat 48 accessions pertanyents a les espècies S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S. dasyphyllum i S. incanum mitjançant l’ús de 39 marcadors SNPs. Els anàlisis de PCoA i clúster diferencien les espècies entre elles a més de mostrar la variabilitat genética existent dins d’elles. D’altra banda, els resultats obtinguts en aquest treball també confirmen que els SNPs seleccionats a partir dels transcriptomes de S. incanum i S. aethiopicum efectivament són reals, el que ens permetrà en un futur utilitzar-los en plataformes de genotipat massiu com pot ser SNPplex.

[ES] La berenjena (Solanum melongena) ha sido cultivada durante siglos en todo el mundo y actualmente es uno de los cultivos más importantes economicamente hablando. La relación entre la versión salvaje, semi domestica y cultivada de Solanum melongena ha sido siempre motivo de controvèrsia. Es plausible que la berenjena que se consume hoy en día sea la consecuencia de la domesticación de la especie silvestre Solanum incanum. Por otra parte, la exististencia de una sucesión continua de formes hace que los límites entre taxones muchas veces no sea demasiado claro entre la berenjena y sus especies relacionades. La domesticación de las especies cultivades ha provocado un empobrecimiento genético hasta tal punto en que la berenjena de hoy en día sea susceptible a diferentes enfermedades y plagas. Es en este contexto donde las especies silvestres relacionades tienen un papel interesante, y es que estas han mostrado er una reserva importante de variavilidad genètica y variación alélica para catacteres de interès agronómicos y características cualitativas tanto de la planta como del fruto. La caracterización molecular detallada de col·lecciones de germoplasma nos permitirá estudiar la diversidad además de permitirnos identificar accesiones potencialmente interessantes para la selección y mejora además de la elaboración de estrategias para la conservación y manejo de germoplasma. En este Trabajo se han caracterizado 48 accesiones pertenecientes a S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S. dasyphyllum y S. incanum mediante el uso de 39 marcadores SNPs. El anàlisis de PCoA y de clúster diferencia las especies entre ellas y muestra también la variabilidad genética existente entre elles. Por otra parte, los resultados obtenidos en este Trabajo también confirman que los SNPs seleccionados a partir de los transcriptomes de S. incanum y S. aethiopicum efectivamente son reales, lo cual nos permitirá en un futuro utilizarlos en plataformas de genotipado masivo como puede ser SNPplex.

[EN] The eggplant (Solanum melongena) has been cultivated for centuries all over the world and nowadays is one of the most economical important cultivars. The relationship between the wild and the cultivated version of Solanum melongena has been controversial. It is likely that the consumed eggplant today is the result of the domestication of wild species Solanum incanum. On the other hand the existence of a flux of forms makes unclear the limits between Solanum melongena and its wild relative taxons. The domestication of the cultivated species has ended with a genetic impoverishment and therefore making the eggplant susceptible to many diseases. In this context the wild related species have an interesting role as they are a source of genetic and allelic variation for different important traits. The detailed molecular characterization of germplasm collections will allow us to study the diversity and even identifying potentially interesting accessions for breeding and also to improve the conservation and handle germplasm strategies design. Here we have characterized 48 accessions belonging to the species S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S.dasyphyllum and S. incanum by the use of 39 SNPs markers. The PCoA and cluster analysis are able to distinguish the species between and within them. Moreover, the obtained results also confirm that the SNPs selected from the transcriptomes of S. incanum and S. aethiopicum are indeed real, which in the future will allow us to use them in massive genotyping platforms such SNPplex.