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Detección y análisis de miRNAs implicados en la regulación de la respuesta a estrés en Cucumis melo

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Detección y análisis de miRNAs implicados en la regulación de la respuesta a estrés en Cucumis melo

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dc.contributor.advisor Marqués Romero, María Carmen es_ES
dc.contributor.advisor Forment Millet, José Javier es_ES
dc.contributor.advisor Mulet Salort, José Miguel es_ES
dc.contributor.author Fernández Gómez, Beatriz es_ES
dc.date.accessioned 2016-09-05T08:25:07Z
dc.date.available 2016-09-05T08:25:07Z
dc.date.created 2016-07-18
dc.date.issued 2016-09-05 es_ES
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10251/68690
dc.description.abstract [ES] Las plantas, como organismos sésiles que son, necesitan desarrollar respuestas rápidas y eficientes para poder sobrevivir a los diferentes estreses medioambientales a los que pueden ser sometidas. Existen numerosos estudios acerca de estas respuestas basados en los principios clásicos de la biología molecular, sin embargo, a principios de los 90 se describieron diferentes especies de pequeños RNAs (sRNAs) no codificantes que presentaban actividad reguladora. Todavía queda mucho para comprender el modo de acción de estos sRNAs. La mayoría del conocimiento obtenido hasta el momento está basado en estudios realizados en organismos modelo, como es el caso de Arabidopsis thaliana, sin embargo, poco se conoce acerca de la importancia de estos elementos reguladores en especies cultivadas. Dado que el genoma de Cucumis melo ha sido completamente secuenciado y debido a la importancia económica de esa especie en España, en nuestro laboratorio se sometieron plantas de C. melo var. piel de sapo a diferentes condiciones potencialmente estresantes, y los sRNAs extraídos de ellas se secuenciaron de forma masiva (New Generation Sequencing). De esta forma se identificaron muchas especies diferentes de sRNAs, sin embargo centramos nuestro estudio en una de ellas, los miRNAS, por ser su biosíntesis, estructura y modo de acción bien conocidas. En este ensayo se describe un método para la detección y amplificación específica de miRNAs maduros de C. melo, algunos de los cuales pueden estar implicados en la regulación de las respuestas a estrés. Además, se analizó la acumulación relativa de éstos en diferentes condiciones de estrés por RT-PCR cuantitativa, y los resultados obtenidos se emplearon para validar los datos obtenidos de la secuenciación masiva. Adicionalmente, se estudió la abundancia relativa de las posibles dianas de mRNA de estos miRNAs con el fin de poder establecer una correlación entre ellos e intentar inferir el modo de acción. es_ES
dc.description.abstract [EN] Plants, as sessile organisms, need to develop rapid and efficient responses in order to survive to environmental stresses. Many studies were performed regarding this issue based on the classical principles of molecular biology, however in the early 90's new non-coding short RNAs (sRNAs) were identified having regulatory activities, and their mode of action is now starting to be deciphered. Most of the knowledge on sRNAs in plants rely on the studies performed in Arabidopsis thaliana or related model organisms, however little is known about the importance of this regulatory elements in crops. Taking advantage of the complete sequencing of the Cucumis melo genome and the economical importance of this crop in Spain, in our lab plants of C. melo var. piel de sapo were subjected to several stresful conditons and their sRNAs were extracted and subjected to New Generation Sequencing (NGS). Many different species of sRNAs were identified, however we centered our study in miRNAs, whose biosinthesis, structure and mode of action have been described in depth. In this essay we describe a method to detect and amplify specific mature miRNAs of C. melo putatively involved in the regulation of stress responses. Furthermore, their relative accumulation under different stress conditions was assayed by real-time RT-PCR and the results were used to validate the data obtained by NGS. Additionally, RT-qPCR was also employed to elucidate the effect of these miRNAs in the relative abundance of their mRNA targets in order to better understand their mode of action. es_ES
dc.format.extent 51 es_ES
dc.language Español es_ES
dc.publisher Universitat Politècnica de València es_ES
dc.rights Reconocimiento - No comercial - Sin obra derivada (by-nc-nd) es_ES
dc.subject Cucumis melo es_ES
dc.subject Estrés abiótico es_ES
dc.subject Estrés biótico es_ES
dc.subject Pequeños RNAs no codificantes es_ES
dc.subject miRNAs es_ES
dc.subject Secuenciación masiva es_ES
dc.subject RT-PCR a tiempo real/cuantitativa es_ES
dc.subject Abiotic stress es_ES
dc.subject Biotic stress es_ES
dc.subject non-coding short RNAs es_ES
dc.subject New Generation Sequencing es_ES
dc.subject Real-Time RT-PCR es_ES
dc.subject.classification BIOQUIMICA Y BIOLOGIA MOLECULAR es_ES
dc.subject.other Grado en Biotecnología-Grau en Biotecnologia es_ES
dc.title Detección y análisis de miRNAs implicados en la regulación de la respuesta a estrés en Cucumis melo es_ES
dc.type Proyecto/Trabajo fin de carrera/grado es_ES
dc.rights.accessRights Abierto es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Departamento de Biotecnología - Departament de Biotecnologia es_ES
dc.contributor.affiliation Universitat Politècnica de València. Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural - Escola Tècnica Superior d'Enginyeria Agronòmica i del Medi Natural es_ES
dc.description.bibliographicCitation Fernández Gómez, B. (2016). Detección y análisis de miRNAs implicados en la regulación de la respuesta a estrés en Cucumis melo. http://hdl.handle.net/10251/68690. es_ES
dc.description.accrualMethod TFGM es_ES
dc.relation.pasarela TFGM\48727 es_ES


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