Browsing by Subject "Bioinformatics"

Actualización y validación de un protocolo para la identificación genética de plantas ornamentales tóxicas.

Herrera Ballester, Manuela (2014-05-19)

[ES] Optimización de un protocolo para la identificación genética de seis plantas ornamentales, Melia azedarach, Mirabilis jalapa, Nerium oleander, Pittosporum tobira, Prunus armeniaca y Ricinus communis, las cuales ...

Análisis de datos de genotipado a gran escala

Martínez Giménez, Felipe (2015-10-22)

[ES] Las nuevas tecnologías de secuenciación y genotipado han abaratado el coste de estos análisis y propiciado el desarrollo de proyectos que contemplan el análisis de cientos o miles de individuos. Además, estas tecnologías ...

Análisis de la expresión alternativa de isoformas en el tiempo mediante datos de RNA-seq

Martorell Marugán, Jordi (2015-09-04)

[ES] Los avances en tecnologías de secuenciación masiva han dado lugar al desarrollo de la transcriptómica por secuenciación, que permite analizar la expresión de genes e isoformas. El laboratorio de Genómica de la Expresión ...

Application of genomic tools in plant breeding

Pérez de Castro, Ana María; Vilanova Navarro, Santiago; Cañizares Sales, Joaquín; Pascual Bañuls, Laura; Blanca Postigo, José Miguel; Díez Niclós, Mª José Teresa de Jesús; Prohens Tomás, Jaime; Picó Sirvent, María Belén (Bentham Science Publishers, 2012-05)

[EN] Plant breeding has been very successful in developing improved varieties using conventional tools and methodologies. Nowadays, the availability of genomic tools and resources is leading to a new revolution of plant ...

Chemometric Approaches for Systems Biology

Folch Fortuny, Abel (2017-01-23)

The present Ph.D. thesis is devoted to study, develop and apply approaches commonly used in chemometrics to the emerging field of systems biology. Existing procedures and new methods are applied to solve research and ...

Data quality aware analysis of differential expression in RNA-seq with NOISeq R/Bioc package

Tarazona Campos, Sonia; Furió Tarí, Pedro; Turrà, David; Di Pietro, Antonio; Nueda, María José; Ferrer, Alberto; Conesa, Ana (Oxford University Press (OUP), 2015-12-02)

[EN] As the use of RNA-seq has popularized, there is an increasing consciousness of the importance of experimental design, bias removal, accurate quantification and control of false positives for proper data analysis. We ...

Del Esquema Conceptual al Mundo Real, una Base de Datos Genómica

Eraso Schattka, Luis Eduardo (2011-07-28)

Existen muchas técnicas para el diseño y desarrollo de sistemas en la actualidad, sin embargo, el uso de técnicas de modelado conceptual esta siendo una práctica cada vez más común entre la ingeniera de software, ya que ...

Desarrollo de una plataforma computacional para el modelado metabólico de microorganismos

Reyes, R.; Garrido, J.; Jaime, R. A.; Córdova, V.; Triana, J.; Villar, L.; Castro, J. C.; Fernández de Córdoba Castellá, Pedro José; Urchueguía Schölzel, Javier Fermín; Navarro Peris, Emilio; Montagud Aquino, Arnau (2011)

[EN] Synthetic biology focuses on the design and construction of artificial genetic systems that are capable of carrying out a specific function after being inserted into a living system. With the development of synthetic ...

Diagen: Modelado e Implementación de un framework para el análisis personalizado del ADN

Villanueva del Pozo, María José (2011-07-28)

Diagen es un framework para la integración y explotación de información genómica para el análisis personalizado de secuencias de ADN. El framework Diagen formaliza cada una de las fases del proceso de análisis mediante ...

Diseño e implementación de un analizador de biosecuencias: Análisis de la elongación en horquilla

Diez Alba, Carlos (2016-09-05)

[ES] Mediante este proyecto se plantea el diseño de un analizador de biosecuencias centrado en el análisis de la elongación en horquilla (hairpin lengthening), una operación natural sobre lenguajes formales inspirada en ...

Diseño e implementación de un analizador de biosecuencias: Análisis de mutaciones en nucleótidos

Zamuner Antón, Martín Gabriel (2016-09-30)

[ES] En el presente Trabajo Fin de Grado se desarrollará un analizador de secuencias de carácter bioquímico (fundamentalmente, secuencias de ADN y de ARN) para la búsqueda de posibles mutaciones debidas a la modificación, ...

Diseño e implementación de un analizador de biosecuencias: Análisis de subsecuencias de repetición

Villar Lafuente, Carlos José (2016-09-07)

[ES] En el presente TFG se desarrollará un analizador de secuencias de carácter bioquímico (fundamentalmente, secuencias de ADN y de ARN) para la búsqueda de posibles mutaciones debidas a la repetición de subsecuencias. ...

Diseño y adaptación de herramientas de visualización de grafos de anotación en metagenoma

Lyeuta Tykhovod, Vladyslav (2016-09-07)

[ES] Gracias al desarrollo de las tecnologías, los campos dentro de la Bioinformática se ven favorecidos al aumentar la cantidad de datos experimentales con los que pueden trabajar. El problema aparece cuando se intenta ...

Evaluation of sequencing technologies Single Cell in the field of systems biology.

Traver Larraz, Diego (2017-09-08)

[EN] Systems biology enables us to make a mechanical approach of human illnesses, or in general of the phenotypic characteristics of the population. In this scene modelling and analysis of the changes in some parts from ...

Evolución de las regiones reguladoras de la transcripción en el complejo de Mycobacterium tuberculosis

Moreno Molina, Miguel Ángel (2015-09-04)

[ES] La bacteria de la tuberculosis mata a más de un millón y medio de personas al año y representa un problema de salud global. Las técnicas genómicas están permitiendo entenderla mejor de tal manera que la cantidad ...

Implementación de herramientas para el análisis de datos multi-ómicos en una librería de R

Martínez Mira, Carlos (2015-10-22)

[ES] Los avances en tecnologías de secuenciación masiva permiten obtener datos de expresión génica y también de sus elementos reguladores y productos. Integrar estas medidas multiómicas en un modelo estadístico que explique ...

Including metagenomic analysis in Blast2GO

Pérez García, José Antonio (2018-09-19)

[EN] Bioinformatics is a discipline that is increasingly prevalent nowadays, its objective is the management and treatment, at a computational and statistical level, of biological or medical data. Within this area is ...

Infraestructura computacional para el análisis de datos de secuenciación genómica

Escobar López, Pablo (2013-06-18)

[ES] Descripción de la colaboración en un proyecto de secuenciación de ADN humano. En el proyecto se ha participado diseñando y administrando el sistema de cómputo de altas prestaciones donde se almacenan y procesan todas ...

Integration of multi-omics data to describe link between developmental exposure to pesticides and impaired neurodevelopment

Bernabeu Gómez, Elena (2016-07-28)

[EN] In recent years the omics disciplines have made their way across a wider spectrum of research groups, thus leading to the generation of multi-omics data sets in a great number of studies. While traditional omics ...

Sparse Manifold Clustering and Embedding to discriminategene expression profiles of glioblastoma and meningioma tumors

García Gómez, Juan Miguel; Gómez-Sanchis, Juan; Escandell-Montero, Pablo; Fuster García, Elíes; Soria-Olivas, Emilio (Elsevier, 2013-11)

Sparse Manifold Clustering and Embedding (SMCE) algorithm has been recently proposed for simultaneous clustering and dimensionality reduction of data on nonlinear manifolds using sparse representation techniques. In ...

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